52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4358 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4358  phage integrase family protein  100 
 
 		 221 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.436387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4571  integrase family protein  84.62 
 
 		 221 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.624666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5700  integrase family protein  30.29 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5382  phage integrase  30.28 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31221  hitchhiker  0.00239771 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4451  phage integrase  30.56 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6742  integrase family protein  33.49 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2063  phage integrase family protein  28.97 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.668188  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  25.96 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  28.23 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1075  integrase family protein  26.94 
 
 		 190 aa  72  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  27.14 
 
 		 188 aa  72  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  26.32 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0140  hypothetical protein  26.61 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  25.24 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  22.64 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2245  hypothetical protein  27.16 
 
 		 314 aa  65.5  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.468605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  25.12 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  25.84 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4322  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205034  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  34.38 
 
 		 322 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0900  integrase  34.38 
 
 		 322 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000819417  hitchhiker  0.000000626468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3476  integrase family protein  39.68 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2565  hypothetical protein  25.31 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  38.24 
 
 		 182 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1565  phage integrase family protein  20.43 
 
 		 317 aa  48.5  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210846  normal  0.0264198 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0196  integrase family protein  32.31 
 
 		 328 aa  48.1  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000565414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  24.88 
 
 		 498 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1900  phage integrase family protein  23.32 
 
 		 331 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125862  hitchhiker  0.00365877 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  24.65 
 
 		 309 aa  47.8  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0872  phage integrase family protein  28.12 
 
 		 324 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  28.02 
 
 		 336 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  34.15 
 
 		 411 aa  45.1  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  33.33 
 
 		 327 aa  45.1  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  36.54 
 
 		 436 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  24.26 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_002950  PG1113  integrase  31.58 
 
 		 407 aa  44.3  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0890  integrase family protein  36.54 
 
 		 436 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.304857  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  24.87 
 
 		 395 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  24.87 
 
 		 312 aa  43.5  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  39.13 
 
 		 616 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  38.78 
 
 		 409 aa  43.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.33 
 
 		 355 aa  42.7  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  34.33 
 
 		 412 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  38.78 
 
 		 409 aa  43.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  25.24 
 
 		 313 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  32.84 
 
 		 406 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.67 
 
 		 311 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  30 
 
 		 435 aa  42  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  25.97 
 
 		 330 aa  42  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.81 
 
 		 313 aa  42  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  32.58 
 
 		 406 aa  42  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  36.84 
 
 		 397 aa  41.6  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>