93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1090 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
299 aa  616  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  99 
 
 
299 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  98.33 
 
 
299 aa  607  1e-172  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  88.96 
 
 
299 aa  556  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  81.85 
 
 
307 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  81.85 
 
 
307 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  81.85 
 
 
307 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  81.18 
 
 
307 aa  469  1e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  79.26 
 
 
307 aa  455  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  50 
 
 
293 aa  315  6e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  52.42 
 
 
293 aa  311  8e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  53.24 
 
 
444 aa  309  3e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  51.92 
 
 
404 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  50.56 
 
 
295 aa  308  1e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  52.52 
 
 
395 aa  307  1e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  51.92 
 
 
486 aa  308  1e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  51.92 
 
 
404 aa  307  2e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  51.92 
 
 
404 aa  307  2e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  52.52 
 
 
395 aa  306  2e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  50.19 
 
 
295 aa  306  2e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  1.47175e-08 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  50.56 
 
 
295 aa  306  2e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  51.92 
 
 
404 aa  307  2e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  56.7 
 
 
291 aa  305  5e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  55.17 
 
 
293 aa  304  1e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 
294 aa  303  2e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  55.17 
 
 
293 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  50.92 
 
 
295 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  50.55 
 
 
295 aa  298  8e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  50.74 
 
 
291 aa  295  7e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  52.4 
 
 
299 aa  291  8e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  47.4 
 
 
287 aa  291  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  54.79 
 
 
296 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  46.79 
 
 
291 aa  274  1e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  44.64 
 
 
291 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  44.81 
 
 
317 aa  265  7e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  45.11 
 
 
303 aa  264  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  44.81 
 
 
317 aa  263  2e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  46.42 
 
 
292 aa  262  5e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  47.39 
 
 
283 aa  256  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  44.33 
 
 
292 aa  253  4e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  44.24 
 
 
289 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  42.71 
 
 
298 aa  234  1e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  39.59 
 
 
304 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  38.69 
 
 
293 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 
288 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  41.01 
 
 
293 aa  213  4e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  37.81 
 
 
288 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.07 
 
 
299 aa  199  4e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  35.21 
 
 
293 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  34.4 
 
 
266 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 
273 aa  164  1e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  32.83 
 
 
273 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.46635e-23 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  35.42 
 
 
292 aa  148  1e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  27.48 
 
 
302 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  3.15394e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  26.41 
 
 
301 aa  66.6  5e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  24.62 
 
 
318 aa  61.2  2e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  23.94 
 
 
278 aa  60.5  3e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  26.67 
 
 
299 aa  60.1  4e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  26.72 
 
 
526 aa  60.5  4e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 
274 aa  55.8  7e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
312 aa  55.1  1e-06  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  24.36 
 
 
337 aa  53.1  5e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  22.14 
 
 
302 aa  53.1  6e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  26 
 
 
319 aa  52  1e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  22.83 
 
 
291 aa  52.4  1e-05  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  1.02654e-05 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  24.27 
 
 
315 aa  52  1e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  26.67 
 
 
319 aa  50.4  3e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  22.41 
 
 
299 aa  50.4  3e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  23.95 
 
 
312 aa  50.1  4e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  24.44 
 
 
335 aa  49.7  5e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  24.44 
 
 
335 aa  49.7  5e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  26.45 
 
 
319 aa  49.7  6e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  24.24 
 
 
312 aa  49.7  6e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  21.16 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.1498e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  22.94 
 
 
342 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 
319 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 
319 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  22.86 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  26.71 
 
 
333 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  21.22 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
444 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  23.41 
 
 
323 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  26.37 
 
 
597 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  22.69 
 
 
325 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  21.61 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  21.61 
 
 
307 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  25 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  27.45 
 
 
329 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  25.4 
 
 
317 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  23.43 
 
 
352 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  25.42 
 
 
319 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  2.19811e-06  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>