More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3606 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3538  diguanylate phosphodiesterase  98.22 
 
 		 506 aa  1024    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.506628  decreased coverage  0.0000122226 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3729  diguanylate phosphodiesterase  95.65 
 
 		 506 aa  996    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3606  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 506 aa  1041    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0705  diguanylate phosphodiesterase  98.22 
 
 		 506 aa  1021    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0814  EAL domain-containing protein  62.35 
 
 		 514 aa  631  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0777  EAL domain-containing protein  60.54 
 
 		 519 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3821  rtn protein  57.63 
 
 		 515 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2339  aminoglycoside response regulator  32.69 
 
 		 526 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000320511  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05448  hypothetical protein  33.33 
 
 		 489 aa  230  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4488  EAL domain protein  30.36 
 
 		 534 aa  230  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2452  hypothetical protein  34.77 
 
 		 518 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000990794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0782  hypothetical protein  32.14 
 
 		 518 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2455  hypothetical protein  34.98 
 
 		 518 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02106  hypothetical protein  32.14 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1481  diguanylate phosphodiesterase  32.14 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849847  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2364  hypothetical protein  34.77 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406164  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2314  hypothetical protein  32.14 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1471  hypothetical protein  32.14 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000861353  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02065  hypothetical protein  32.14 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2566  hypothetical protein  34.77 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233571 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2474  hypothetical protein  32.14 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3314  hypothetical protein  33.11 
 
 		 497 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795943  normal  0.253919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2325  hypothetical protein  32.35 
 
 		 518 aa  228  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.802767  hitchhiker  0.00255877 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4205  EAL domain protein  29.09 
 
 		 535 aa  228  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14530  hypothetical protein  31.1 
 
 		 523 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2409  hypothetical protein  34.77 
 
 		 518 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.948391  hitchhiker  0.000104823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0436  cyclic diguanylate phosphodiesterase  33.26 
 
 		 516 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0237258  hitchhiker  0.0000188077 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0383  hypothetical protein  33.05 
 
 		 516 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0298247  normal  0.0200463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0374  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  33.05 
 
 		 516 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0285785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2785  hypothetical protein  33.48 
 
 		 526 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2710  hypothetical protein  33.48 
 
 		 526 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0376  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.83 
 
 		 516 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000844741  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1286  hypothetical protein  30.29 
 
 		 521 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0396  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.61 
 
 		 516 aa  216  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0476649  hitchhiker  0.000376911 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001510  Rtn protein  31.05 
 
 		 490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2772  hypothetical protein  32.5 
 
 		 518 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2920  diguanylate phosphodiesterase  29.98 
 
 		 511 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2811  EAL domain-containing protein  30.38 
 
 		 538 aa  211  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1268  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  31.02 
 
 		 504 aa  209  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.585411 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2544  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  34.1 
 
 		 532 aa  206  9e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0252853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1373  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  33.72 
 
 		 532 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.295034  normal  0.0183228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01785  predicted phosphodiesterase  33.87 
 
 		 532 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1828  diguanylate phosphodiesterase  33.87 
 
 		 532 aa  201  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.566972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1905  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  33.87 
 
 		 532 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.184783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1818  diguanylate phosphodiesterase  33.87 
 
 		 532 aa  201  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0704068  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1798  diguanylate phosphodiesterase  30.16 
 
 		 520 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199517  normal  0.66089 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1264  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  28.35 
 
 		 521 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0322571  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01143  conserved inner membrane protein  28.35 
 
 		 507 aa  200  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01151  hypothetical protein  28.35 
 
 		 507 aa  200  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2480  diguanylate phosphodiesterase  28.35 
 
 		 521 aa  199  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186873  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2458  diguanylate phosphodiesterase  28.35 
 
 		 521 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.577985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1307  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  28.15 
 
 		 521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.654083  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2384  diguanylate phosphodiesterase  29.27 
 
 		 532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1616  diguanylate phosphodiesterase  28.49 
 
 		 500 aa  197  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59158  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3435  diguanylate phosphodiesterase  30.37 
 
 		 528 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0344  EAL domain-containing protein  38.03 
 
 		 530 aa  195  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2328  diguanylate phosphodiesterase  30.07 
 
 		 528 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3245  hypothetical protein  30.5 
 
 		 528 aa  194  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0153368 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1425  hypothetical protein  36.99 
 
 		 532 aa  193  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1089  diguanylate phosphodiesterase  27.13 
 
 		 512 aa  193  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.725575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05545  sensory transduction protein kinase  30.62 
 
 		 506 aa  192  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  39.86 
 
 		 525 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2438  diguanylate phosphodiesterase  28.17 
 
 		 528 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2501  diguanylate phosphodiesterase  32.15 
 
 		 528 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0965221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1646  diguanylate phosphodiesterase  29.25 
 
 		 501 aa  187  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1559  hypothetical protein  38.08 
 
 		 532 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1983  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  27.58 
 
 		 486 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.123377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0378  LuxR-family transcriptional regulator/cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  40.93 
 
 		 362 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00271  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.51 
 
 		 362 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3291  diguanylate phosphodiesterase  40.51 
 
 		 362 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1967  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  31.98 
 
 		 533 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.352201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  39.06 
 
 		 794 aa  182  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03877  Putative signal protein with EAL domain  40 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3308  diguanylate phosphodiesterase  40.51 
 
 		 362 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2028  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  31.98 
 
 		 533 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1971  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  31.98 
 
 		 533 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00274  hypothetical protein  40.51 
 
 		 362 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1489  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  32.06 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1304  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  31.98 
 
 		 474 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0784457  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5670  diguanylate phosphodiesterase  28.36 
 
 		 529 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.981037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0375  LuxR-family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 362 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.479547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0346  LuxR-family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 362 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0333  LuxR-family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 362 aa  179  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.22 
 
 		 947 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5257  diguanylate phosphodiesterase  29 
 
 		 588 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0193629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3724  EAL-containing signal transduction protein  38.03 
 
 		 536 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2997  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40.32 
 
 		 876 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4985  sensory box protein  40.42 
 
 		 1534 aa  176  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4327  diguanylate phosphodiesterase  27.2 
 
 		 534 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0532926 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2992  diguanylate phosphodiesterase  27.53 
 
 		 522 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0409  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor  37.35 
 
 		 925 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.231334  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5008  diguanylate phosphodiesterase  27.01 
 
 		 534 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5852  diguanylate phosphodiesterase  27.01 
 
 		 534 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4137  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.14 
 
 		 826 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.153825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0378  sensory box protein  40.62 
 
 		 1491 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0214422 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3236  diguanylate phosphodiesterase  29.86 
 
 		 546 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1752  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.36 
 
 		 659 aa  172  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0247  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.27 
 
 		 890 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.08 
 
 		 533 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439369  normal  0.12147 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1930  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.15 
 
 		 735 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>