More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2169 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  336  8e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  43.9 
 
 
161 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  42.14 
 
 
160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  44.06 
 
 
162 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  44.22 
 
 
161 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  45.52 
 
 
159 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  41.96 
 
 
158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  45.24 
 
 
153 aa  114  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  39.51 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  48.03 
 
 
159 aa  112  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  43.36 
 
 
153 aa  111  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  48.28 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  40.56 
 
 
157 aa  107  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  43.57 
 
 
152 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  39.16 
 
 
157 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  39.16 
 
 
157 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  39.16 
 
 
157 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.16 
 
 
157 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  39.16 
 
 
157 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  39.86 
 
 
157 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.16 
 
 
157 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  39.16 
 
 
157 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  46.22 
 
 
160 aa  104  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  38.46 
 
 
157 aa  104  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  43.88 
 
 
152 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  42.19 
 
 
150 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  37.86 
 
 
160 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  41.33 
 
 
155 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  40.31 
 
 
154 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  40.31 
 
 
154 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  39.29 
 
 
152 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  38.75 
 
 
187 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  38.46 
 
 
163 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  38.85 
 
 
163 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  37.16 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  37.06 
 
 
157 aa  99.8  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  45.95 
 
 
143 aa  98.6  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 
173 aa  97.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  40.98 
 
 
158 aa  97.4  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  39.83 
 
 
161 aa  97.4  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  35.77 
 
 
156 aa  96.7  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  37.76 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  36.05 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  41.38 
 
 
163 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  39.04 
 
 
160 aa  94.4  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  42.96 
 
 
184 aa  94  9e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  42.4 
 
 
523 aa  92.8  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  40.14 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  37.67 
 
 
171 aa  91.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  37.24 
 
 
189 aa  91.7  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  36.65 
 
 
167 aa  90.9  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  43.64 
 
 
182 aa  90.9  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  38.35 
 
 
161 aa  90.9  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  39.87 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  41.86 
 
 
165 aa  88.6  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  38.57 
 
 
149 aa  88.6  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  39.84 
 
 
143 aa  88.6  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  41.61 
 
 
161 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  42.75 
 
 
168 aa  88.2  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  39.24 
 
 
155 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  40.29 
 
 
147 aa  88.2  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  36.3 
 
 
504 aa  88.2  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  36.91 
 
 
157 aa  87.4  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  45.95 
 
 
163 aa  87  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  42.24 
 
 
183 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  42.24 
 
 
183 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  37.41 
 
 
153 aa  86.3  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  41.01 
 
 
161 aa  85.5  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  42.24 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  37.41 
 
 
146 aa  85.1  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  43.1 
 
 
154 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  39.2 
 
 
158 aa  84.7  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  37.76 
 
 
505 aa  85.1  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  84.3  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  37.96 
 
 
513 aa  84.3  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  37.96 
 
 
513 aa  84.3  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  34.44 
 
 
152 aa  84.3  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  37.4 
 
 
164 aa  84  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  38.41 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  34.31 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0082  hypothetical protein  40.74 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.659659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3882  protein of unknown function UPF0079  42.22 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  38.4 
 
 
503 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  33.96 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  42.34 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  42.61 
 
 
562 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  38 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  39.44 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  38.93 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  45.79 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  44.54 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  40.34 
 
 
506 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  35.09 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  42.34 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  41.55 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  35.97 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  40.98 
 
 
506 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  42.54 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  39.44 
 
 
540 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  45.79 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>