More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1962 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 
329 aa  663    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.03 
 
 
319 aa  322  5e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  47.52 
 
 
320 aa  295  8e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.33 
 
 
335 aa  285  5e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.06 
 
 
323 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0820  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.78 
 
 
321 aa  209  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.22 
 
 
339 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2985  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.51 
 
 
320 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000162336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.16 
 
 
296 aa  159  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  35.17 
 
 
340 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.51 
 
 
342 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.92 
 
 
348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.5 
 
 
260 aa  155  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.93 
 
 
313 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.1 
 
 
299 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.82 
 
 
290 aa  152  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  41.18 
 
 
301 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.28 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  35.8 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.09 
 
 
298 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.84 
 
 
299 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.74 
 
 
335 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.29 
 
 
298 aa  142  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.25 
 
 
274 aa  139  6e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.58 
 
 
272 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.66 
 
 
295 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.82 
 
 
366 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.58 
 
 
272 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.11 
 
 
336 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.97 
 
 
297 aa  136  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.78 
 
 
282 aa  135  8e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.95 
 
 
831 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.63 
 
 
295 aa  133  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.64 
 
 
563 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.98 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.29 
 
 
382 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.29 
 
 
382 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.38 
 
 
274 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1825  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.33 
 
 
307 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0185284  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  36.87 
 
 
270 aa  129  8.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.36 
 
 
587 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  36.62 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1225  peptidase S49  37.12 
 
 
555 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0362989  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  33.17 
 
 
569 aa  126  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.86 
 
 
338 aa  125  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.76 
 
 
649 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  34.38 
 
 
270 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.56 
 
 
611 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  33.06 
 
 
269 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  35.35 
 
 
623 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.61 
 
 
269 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.43 
 
 
605 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  33.19 
 
 
272 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.63 
 
 
296 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.98 
 
 
656 aa  123  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.89 
 
 
290 aa  123  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  36.87 
 
 
273 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.18 
 
 
325 aa  122  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  33.73 
 
 
583 aa  122  7e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.82 
 
 
270 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  38.59 
 
 
270 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1138  signal peptide peptidase A  33.85 
 
 
834 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.73 
 
 
327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.88 
 
 
593 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  33.18 
 
 
608 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.88 
 
 
593 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.34 
 
 
547 aa  120  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  33.33 
 
 
618 aa  120  3e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.5 
 
 
311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.33 
 
 
293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.9 
 
 
562 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.78 
 
 
293 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.04 
 
 
626 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1819  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.56 
 
 
571 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  34.48 
 
 
618 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1937  signal peptide peptidase A  35.56 
 
 
410 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.003866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.62 
 
 
566 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.14 
 
 
595 aa  119  9e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  38.42 
 
 
601 aa  119  9e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  35.64 
 
 
269 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  35.71 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  35.35 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.8 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.1 
 
 
834 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  37.17 
 
 
269 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.52 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.87 
 
 
620 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.38 
 
 
383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  39.08 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  37.64 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.8 
 
 
637 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  36.87 
 
 
273 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.84 
 
 
590 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1267  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.62 
 
 
834 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.77 
 
 
585 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.43 
 
 
334 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.84 
 
 
589 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.86 
 
 
594 aa  116  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.12 
 
 
593 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.33 
 
 
596 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.789825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>