More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1785 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
367 aa  738    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  46.57 
 
 
355 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  43.19 
 
 
354 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  43.77 
 
 
354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  45.14 
 
 
355 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  46.7 
 
 
355 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.29 
 
 
355 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  44.63 
 
 
356 aa  295  7e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.78 
 
 
383 aa  281  9e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  41.35 
 
 
369 aa  277  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  40.33 
 
 
376 aa  276  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.66 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  42.94 
 
 
355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.24 
 
 
374 aa  263  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  39.83 
 
 
383 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  38.2 
 
 
375 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.11 
 
 
383 aa  261  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.8 
 
 
372 aa  260  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  41.64 
 
 
367 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  38.27 
 
 
383 aa  256  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  36.49 
 
 
373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  37.23 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.28 
 
 
383 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  38.33 
 
 
383 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.1 
 
 
377 aa  246  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.15 
 
 
392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  41.64 
 
 
360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  40 
 
 
354 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.15 
 
 
385 aa  239  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.99 
 
 
357 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.55 
 
 
347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.7 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  38.26 
 
 
379 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.49 
 
 
372 aa  229  5e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  35.26 
 
 
354 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  34.25 
 
 
386 aa  226  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.29 
 
 
353 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  35.64 
 
 
386 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.22 
 
 
361 aa  223  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  35.64 
 
 
386 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  35.64 
 
 
386 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  35.85 
 
 
386 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.68 
 
 
339 aa  218  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  36.1 
 
 
347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  35.54 
 
 
370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.81 
 
 
379 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  34.9 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  35.82 
 
 
370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  35.43 
 
 
338 aa  213  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.18 
 
 
380 aa  212  7.999999999999999e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  35 
 
 
396 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.23 
 
 
350 aa  211  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  36.29 
 
 
381 aa  209  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  36.24 
 
 
367 aa  209  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.23 
 
 
379 aa  209  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  36.42 
 
 
384 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  35.94 
 
 
379 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  38.44 
 
 
369 aa  207  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.07 
 
 
368 aa  205  1e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  31.55 
 
 
373 aa  203  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  35.63 
 
 
352 aa  203  5e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.27 
 
 
366 aa  201  9.999999999999999e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.24 
 
 
343 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.17 
 
 
368 aa  199  6e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.26 
 
 
368 aa  197  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  36.54 
 
 
341 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0860  RIP metalloprotease RseP  38.42 
 
 
370 aa  195  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.97 
 
 
332 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.27 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0296  membrane-associated zinc metalloprotease  35.47 
 
 
381 aa  186  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.4 
 
 
335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.4 
 
 
335 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.38 
 
 
418 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.38 
 
 
420 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  29.38 
 
 
420 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  29.38 
 
 
420 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.38 
 
 
418 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  29.38 
 
 
420 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  29.38 
 
 
420 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.65 
 
 
377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  28.91 
 
 
418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3629  peptidase M50  31.75 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.91 
 
 
418 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  33.98 
 
 
353 aa  175  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0689  peptidase M50  31.67 
 
 
376 aa  175  9e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000148024  hitchhiker  3.25567e-17 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  29.76 
 
 
377 aa  175  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1809  membrane-associated zinc metalloprotease  32.13 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.489906  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.83 
 
 
561 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  39.83 
 
 
561 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  39.83 
 
 
561 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.32 
 
 
455 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  31.79 
 
 
388 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.3 
 
 
345 aa  166  8e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_314  membrane-associated zinc metalloprotease  32.86 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.18 
 
 
455 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0352  peptidase M50  32.01 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  32.96 
 
 
348 aa  162  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  31.71 
 
 
337 aa  162  7e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  30.81 
 
 
336 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.18 
 
 
351 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>