More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0283 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  100 
 
 		 277 aa  560  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  67.51 
 
 		 274 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  67.51 
 
 		 274 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  67.51 
 
 		 274 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  67.15 
 
 		 274 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  64.62 
 
 		 274 aa  371  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  64.26 
 
 		 274 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  64.26 
 
 		 274 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  64.62 
 
 		 274 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  62.09 
 
 		 274 aa  352  5e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  56.32 
 
 		 274 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  37.59 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  34.42 
 
 		 290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  40.6 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  41.31 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  41.15 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  36.41 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  34.76 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  32.23 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  32.57 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  31.22 
 
 		 280 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  35.1 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  26.55 
 
 		 298 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  31.25 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  29.76 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  29.67 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  27.57 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  28.95 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  27.06 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  27.16 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  33.48 
 
 		 340 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  26.89 
 
 		 440 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1043  putative signal transduction protein  27.88 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  24.31 
 
 		 297 aa  99.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 286 aa  99.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  26.57 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  29.29 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  29.41 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  27.98 
 
 		 283 aa  96.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  30.73 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25.28 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  27.98 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  29.41 
 
 		 274 aa  95.5  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  30.69 
 
 		 280 aa  95.5  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  29.41 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  27.27 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  30.63 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  26.03 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  29.85 
 
 		 258 aa  94  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  27.88 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  31.14 
 
 		 397 aa  93.6  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  30.63 
 
 		 544 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  26.5 
 
 		 282 aa  92.4  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  28.5 
 
 		 304 aa  92  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  28.64 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  28.57 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  27.51 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  25.42 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  25.71 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  27.5 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  30.99 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  27.85 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 		 378 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  25 
 
 		 496 aa  89.4  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 		 412 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  25.26 
 
 		 284 aa  88.6  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  27.14 
 
 		 351 aa  89  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  26.48 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  22.22 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  26.32 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  26.48 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  30.11 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  28.95 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  22.97 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  31.22 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  23.21 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  26.37 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4198  putative signal transduction protein  31.36 
 
 		 288 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  27.38 
 
 		 353 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  24.4 
 
 		 281 aa  86.3  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  27.11 
 
 		 718 aa  85.9  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  25.64 
 
 		 290 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  26.28 
 
 		 288 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  25.35 
 
 		 407 aa  85.5  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  24.1 
 
 		 279 aa  85.5  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0413  hypothetical protein  27.42 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  22.83 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  22.94 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  22.94 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  28.22 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  27.23 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  30.28 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  28.04 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.02 
 
 		 634 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0875  signal transduction protein  30.89 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>