More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0290 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 		 160 aa  330  4e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  74.19 
 
 		 159 aa  249  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  73.03 
 
 		 159 aa  242  1.9999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  73.68 
 
 		 159 aa  241  3.9999999999999997e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  68.55 
 
 		 159 aa  240  7e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  68.55 
 
 		 159 aa  240  7e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  71.88 
 
 		 160 aa  239  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  67.92 
 
 		 159 aa  238  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  69.03 
 
 		 155 aa  227  5e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  68.28 
 
 		 160 aa  225  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  62.69 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.34 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.66 
 
 		 152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 		 150 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 		 149 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 156 aa  160  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 		 149 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.71 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  55.97 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  55.15 
 
 		 144 aa  158  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 146 aa  155  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.66 
 
 		 152 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  48.3 
 
 		 148 aa  153  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 150 aa  152  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.82 
 
 		 149 aa  153  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  52.63 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  44.37 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 145 aa  151  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1198  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 		 152 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.65 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  52.59 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  50.75 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  48.51 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.85 
 
 		 184 aa  147  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.74 
 
 		 145 aa  147  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 151 aa  147  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  48.87 
 
 		 148 aa  147  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  53.44 
 
 		 144 aa  147  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1521  3-dehydroquinate dehydratase  50.75 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  47.95 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 145 aa  145  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  45.64 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  50.38 
 
 		 152 aa  144  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.1 
 
 		 147 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 147 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  49.25 
 
 		 150 aa  143  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.1 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.89 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.15 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 		 166 aa  140  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 148 aa  140  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  43.97 
 
 		 146 aa  140  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  52.31 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  48.89 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 144 aa  140  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 148 aa  140  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2367  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.79 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0207637  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  49.23 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.04 
 
 		 142 aa  137  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  44.37 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 		 151 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 		 150 aa  137  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>