More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1491 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
247 aa  506  1e-142  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0978937  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
247 aa  506  1e-142  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0264369  hitchhiker  4.70617e-11 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.6 
 
 
247 aa  506  1e-142  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0183678  normal  0.814955 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
247 aa  506  1e-142  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000349992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  93.5 
 
 
247 aa  474  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0083444  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1674  short chain dehydrogenase family protein  91.9 
 
 
247 aa  466  1e-130  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.09 
 
 
258 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000108179  normal  0.0377265 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2774  short chain dehydrogenase family protein  91.09 
 
 
258 aa  462  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  hitchhiker  0.000224975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.09 
 
 
258 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  4.80386e-05  hitchhiker  4.43735e-07 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.16 
 
 
257 aa  415  1e-115  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0573631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.3 
 
 
255 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00108636  hitchhiker  0.000219096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.92 
 
 
255 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0196374  unclonable  1.91957e-08 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.52 
 
 
256 aa  380  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1372  short chain dehydrogenase family protein  68.31 
 
 
274 aa  345  5e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0570365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1335  short chain dehydrogenase family protein  64.34 
 
 
247 aa  334  9e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00551908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.69 
 
 
238 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136725 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 
238 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0366896 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
249 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
247 aa  138  8e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
257 aa  129  5e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.237578  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
222 aa  129  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
249 aa  115  4e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000668025  hitchhiker  1.85563e-06 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
260 aa  82.8  5e-15  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1221  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.43 
 
 
241 aa  81.6  1e-14  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.810471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 
258 aa  70.1  3e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  30.13 
 
 
250 aa  69.7  4e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.49 
 
 
258 aa  69.7  4e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  28.5 
 
 
251 aa  68.6  9e-11  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 
243 aa  67  2e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  26.67 
 
 
245 aa  66.2  4e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  28.68 
 
 
261 aa  65.9  6e-10  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.98 
 
 
260 aa  65.9  6e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.240703 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.03 
 
 
255 aa  65.5  8e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.85 
 
 
247 aa  65.5  8e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0429  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.98 
 
 
260 aa  65.1  9e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.8 
 
 
263 aa  65.1  1e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.79 
 
 
277 aa  65.1  1e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000182624  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.86 
 
 
255 aa  64.7  1e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.98 
 
 
260 aa  65.1  1e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.767614  hitchhiker  0.00534124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 
247 aa  63.9  2e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.73 
 
 
262 aa  63.9  2e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.27 
 
 
245 aa  64.3  2e-09  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  25.71 
 
 
245 aa  64.3  2e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
268 aa  63.9  2e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
277 aa  64.3  2e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4335  short chain dehydrogenase  29.15 
 
 
249 aa  63.5  3e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0693718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4715  short chain dehydrogenase  29.15 
 
 
249 aa  63.5  3e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4421  short chain dehydrogenase  29.15 
 
 
249 aa  63.5  3e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.51 
 
 
264 aa  63.5  3e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26 
 
 
250 aa  63.2  4e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  25.93 
 
 
249 aa  63.2  4e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2951  short chain dehydrogenase  24.63 
 
 
276 aa  62.8  4e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.2 
 
 
262 aa  63.2  4e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1853  short chain dehydrogenase  27.53 
 
 
249 aa  63.2  4e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.787999  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.58 
 
 
248 aa  62.8  5e-09  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.88 
 
 
276 aa  62.8  5e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  26.4 
 
 
256 aa  62.8  5e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1759  hypothetical protein  26.53 
 
 
240 aa  62.4  6e-09  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.88 
 
 
266 aa  62.4  7e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1201  short chain dehydrogenase  27.23 
 
 
289 aa  62  8e-09  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0718298  normal  0.0224844 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.45 
 
 
264 aa  62  8e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.42 
 
 
263 aa  61.2  1e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  29.01 
 
 
266 aa  61.6  1e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  2.29698e-08 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10962  short chain dehydrogenase  27.86 
 
 
253 aa  61.2  1e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.247015 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26 
 
 
249 aa  61.6  1e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6265  short chain dehydrogenase  31.01 
 
 
257 aa  61.6  1e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.01 
 
 
266 aa  61.2  1e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4881  short chain dehydrogenase  26.72 
 
 
249 aa  60.5  2e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.968651 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0469  short chain dehydrogenase  27.96 
 
 
292 aa  60.8  2e-08  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  23.33 
 
 
250 aa  60.5  2e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.62 
 
 
264 aa  60.5  2e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3511  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.18 
 
 
264 aa  60.8  2e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.531457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  25.62 
 
 
264 aa  60.1  3e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.6 
 
 
239 aa  60.1  3e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  25.62 
 
 
264 aa  60.1  3e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.6 
 
 
239 aa  60.1  3e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59131e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.46 
 
 
242 aa  60.5  3e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.46 
 
 
242 aa  60.5  3e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.6 
 
 
239 aa  60.1  3e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.61938e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.46 
 
 
242 aa  60.5  3e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.6 
 
 
239 aa  60.1  3e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.6 
 
 
239 aa  60.1  3e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  8.94376e-15 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.46 
 
 
242 aa  60.5  3e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12310  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  29.22 
 
 
270 aa  60.1  3e-08  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.3676  normal  0.223065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1188  short chain dehydrogenase  26.73 
 
 
291 aa  60.1  3e-08  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0152839  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.46 
 
 
242 aa  60.5  3e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.57 
 
 
245 aa  59.7  4e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  25.62 
 
 
264 aa  59.7  4e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.08 
 
 
239 aa  60.1  4e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  25.42 
 
 
246 aa  60.1  4e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35320  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  27.76 
 
 
249 aa  59.7  4e-08  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135035  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.17 
 
 
254 aa  59.7  4e-08  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.62 
 
 
264 aa  59.7  4e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.62 
 
 
264 aa  59.7  4e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  26.86 
 
 
244 aa  59.3  6e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.56 
 
 
247 aa  58.9  6e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.39 
 
 
253 aa  59.3  6e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.62 
 
 
264 aa  58.9  6e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  25.5 
 
 
269 aa  58.9  7e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.31 
 
 
244 aa  58.9  8e-08  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>