More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4120 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  55.06 
 
 		 689 aa  667    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  56.04 
 
 		 708 aa  716    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  56.06 
 
 		 712 aa  704    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  53.31 
 
 		 717 aa  635    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  55.13 
 
 		 701 aa  697    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  54.53 
 
 		 736 aa  645    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  52.23 
 
 		 709 aa  644    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  52.51 
 
 		 787 aa  666    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  58.65 
 
 		 682 aa  684    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 719 aa  1408    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  53.46 
 
 		 726 aa  678    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  53.73 
 
 		 717 aa  692    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  61.44 
 
 		 697 aa  777    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  53.33 
 
 		 710 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  57 
 
 		 694 aa  655    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  56.14 
 
 		 674 aa  641    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  56.61 
 
 		 702 aa  677    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  93.46 
 
 		 719 aa  1268    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  53.56 
 
 		 707 aa  633  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  53.43 
 
 		 700 aa  631  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  55.09 
 
 		 707 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  55.29 
 
 		 714 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  55.01 
 
 		 707 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  52.12 
 
 		 697 aa  621  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  48.52 
 
 		 710 aa  607  9.999999999999999e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  54.01 
 
 		 759 aa  608  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  54.48 
 
 		 685 aa  597  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  47.91 
 
 		 704 aa  591  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  51.64 
 
 		 688 aa  588  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  51.41 
 
 		 684 aa  581  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  52.19 
 
 		 670 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  52.17 
 
 		 685 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  46.28 
 
 		 690 aa  554  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  49.57 
 
 		 699 aa  550  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  60.2 
 
 		 876 aa  449  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  44.46 
 
 		 643 aa  366  1e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.56 
 
 		 773 aa  277  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.11 
 
 		 762 aa  272  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.78 
 
 		 763 aa  270  8.999999999999999e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  32.02 
 
 		 735 aa  268  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  44.59 
 
 		 508 aa  269  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.88 
 
 		 737 aa  264  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  33.75 
 
 		 739 aa  263  6e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.16 
 
 		 718 aa  263  6e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.33 
 
 		 694 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  34 
 
 		 746 aa  260  6e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  29.08 
 
 		 689 aa  259  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.47 
 
 		 742 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  34.85 
 
 		 706 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  32.21 
 
 		 762 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  30.05 
 
 		 625 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  28.44 
 
 		 724 aa  254  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  28.15 
 
 		 689 aa  253  9.000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  33.8 
 
 		 707 aa  253  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  35.25 
 
 		 726 aa  253  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  39.32 
 
 		 515 aa  251  4e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.33 
 
 		 858 aa  249  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.68 
 
 		 785 aa  246  8e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.59 
 
 		 732 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  29.66 
 
 		 681 aa  244  5e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.7 
 
 		 685 aa  243  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  31.03 
 
 		 744 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.52 
 
 		 725 aa  241  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.12 
 
 		 734 aa  240  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.39 
 
 		 686 aa  240  9e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  30.53 
 
 		 678 aa  239  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  27.23 
 
 		 659 aa  239  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  30.55 
 
 		 714 aa  239  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  28.76 
 
 		 741 aa  238  4e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.04 
 
 		 786 aa  238  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  30.91 
 
 		 678 aa  237  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  32.1 
 
 		 728 aa  237  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  32.66 
 
 		 727 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  32.27 
 
 		 743 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  31.56 
 
 		 736 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  32.1 
 
 		 728 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.28 
 
 		 797 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  29.3 
 
 		 696 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  32.73 
 
 		 760 aa  234  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  28 
 
 		 757 aa  234  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  31.85 
 
 		 726 aa  234  6e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  33.93 
 
 		 797 aa  234  6e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  30.78 
 
 		 705 aa  233  8.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3376  UvrD/REP helicase  32.69 
 
 		 659 aa  233  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  32.76 
 
 		 728 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  31.92 
 
 		 742 aa  233  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  30.4 
 
 		 678 aa  233  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  32.76 
 
 		 728 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  33.38 
 
 		 726 aa  233  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  34.03 
 
 		 797 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.04 
 
 		 711 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.42 
 
 		 730 aa  231  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.42 
 
 		 730 aa  231  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  28.53 
 
 		 706 aa  231  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  30.59 
 
 		 731 aa  231  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  28.4 
 
 		 765 aa  231  5e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.66 
 
 		 729 aa  231  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  27.29 
 
 		 749 aa  230  9e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.46 
 
 		 730 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  30.05 
 
 		 669 aa  228  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>