147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0905 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  275  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  50.79 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  48.46 
 
 		 135 aa  135  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  49.61 
 
 		 548 aa  135  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  50.39 
 
 		 541 aa  133  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  48.82 
 
 		 548 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  43.75 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  47.29 
 
 		 550 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  47.29 
 
 		 550 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  44.29 
 
 		 155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  46.51 
 
 		 550 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  38.76 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  40.91 
 
 		 137 aa  104  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  36.36 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  37.12 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  36.09 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  36.09 
 
 		 137 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  40 
 
 		 321 aa  90.5  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  35.71 
 
 		 319 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  36.64 
 
 		 139 aa  89.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  37.98 
 
 		 319 aa  87  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  34.33 
 
 		 143 aa  83.6  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  37.9 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  33.88 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  42.37 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  35.34 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  32.85 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  35.71 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  32.8 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  34.51 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  35.16 
 
 		 315 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  33.85 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  32.79 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  36.79 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  27.13 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  34.13 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  31.58 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  29.37 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  31.71 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  31.82 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  31.5 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  31.25 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  31.67 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  33.61 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  32 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  30.7 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  29.51 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  35.2 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  27.27 
 
 		 311 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  33.59 
 
 		 305 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  34.4 
 
 		 322 aa  61.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  32.31 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  33.08 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  33.08 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  33.08 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  33.08 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  33.08 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  33.08 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  33.08 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  33.08 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  29.31 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  28.45 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  32.23 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  30.91 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  29.51 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  33.93 
 
 		 311 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  33.72 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  28.12 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  33.61 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  29.2 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2366  hypothetical protein  31.03 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  30.4 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  30.23 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  27.87 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  33.85 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  33.85 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  33.85 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  25.81 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  27.87 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  30.4 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  31.09 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  30.23 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  28.57 
 
 		 324 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  25.2 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  28.57 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  30.36 
 
 		 317 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  32.48 
 
 		 333 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  26.92 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  28.57 
 
 		 318 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  28.57 
 
 		 318 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  25.66 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  33.67 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  29.81 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  29.46 
 
 		 317 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  26.52 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  30.09 
 
 		 319 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  26.96 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2360  hypothetical protein  29.1 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>