More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0756 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  100 
 
 		 376 aa  756    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  62.91 
 
 		 378 aa  418  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  60.76 
 
 		 380 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  60.77 
 
 		 373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  58.05 
 
 		 363 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  59.2 
 
 		 375 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  58.05 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  57.26 
 
 		 378 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  60.29 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  57.23 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  58.91 
 
 		 381 aa  386  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  54.49 
 
 		 385 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  54.42 
 
 		 359 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  56.86 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  54.71 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  52.86 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  56.9 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  51.81 
 
 		 372 aa  362  8e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  52.49 
 
 		 371 aa  355  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  56.2 
 
 		 356 aa  353  2e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  49.57 
 
 		 360 aa  352  8.999999999999999e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  51.61 
 
 		 358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  52.05 
 
 		 368 aa  334  1e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  49.71 
 
 		 353 aa  318  7e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  48.41 
 
 		 359 aa  318  9e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  51.33 
 
 		 369 aa  317  3e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  54.6 
 
 		 355 aa  317  3e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  48.66 
 
 		 357 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  45.88 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  49.42 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  48.53 
 
 		 371 aa  300  3e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  44.67 
 
 		 364 aa  300  4e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  48.41 
 
 		 369 aa  299  5e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  46.49 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  46.49 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  46.29 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  43.93 
 
 		 367 aa  295  6e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  46.89 
 
 		 374 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  44.61 
 
 		 364 aa  288  8e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  46.47 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  47.38 
 
 		 405 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  45.15 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  45.88 
 
 		 356 aa  282  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  45.88 
 
 		 356 aa  282  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1442  DNA polymerase IV (Pol IV 3)  46.29 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3809  DNA-directed DNA polymerase  66.35 
 
 		 412 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  44.96 
 
 		 361 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  44.96 
 
 		 383 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  44.96 
 
 		 408 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  45.21 
 
 		 379 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1128  DNA polymerase IV  46.76 
 
 		 429 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456598  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  47.06 
 
 		 392 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2052  DNA polymerase IV  46.51 
 
 		 407 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0383  ImpB/MucB/SamB family protein  45.29 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00108419  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  46.33 
 
 		 359 aa  272  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  45.69 
 
 		 359 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  44.57 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  46.88 
 
 		 418 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  45.4 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  45.75 
 
 		 359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  49.18 
 
 		 362 aa  268  8e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1114  DNA polymerase IV  46.09 
 
 		 357 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  45.93 
 
 		 399 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  48.67 
 
 		 359 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  49.83 
 
 		 357 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  43.92 
 
 		 408 aa  266  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  46.31 
 
 		 418 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  46.29 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  45.03 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2527  DNA polymerase IV  46.48 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  45.38 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  44.69 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  44.44 
 
 		 360 aa  263  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2619  DNA polymerase IV  46.29 
 
 		 403 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2675  DNA polymerase IV  46.29 
 
 		 406 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1727  DNA polymerase IV  46.29 
 
 		 404 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3394  DNA polymerase IV  50 
 
 		 364 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320161  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1508  DNA polymerase IV  46.29 
 
 		 400 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2236  DNA polymerase IV  46.29 
 
 		 400 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.783166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3083  DNA polymerase IV  46.29 
 
 		 400 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  46.29 
 
 		 404 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  44 
 
 		 419 aa  259  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3355  DNA polymerase IV  44.28 
 
 		 358 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0935  DNA polymerase IV  44.28 
 
 		 358 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3552  DNA polymerase IV  44.28 
 
 		 358 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3427  DNA polymerase IV  43.99 
 
 		 358 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  44.29 
 
 		 419 aa  259  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  45.45 
 
 		 369 aa  258  9e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  55.34 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0965  DNA polymerase IV  41.64 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4587  DNA polymerase IV  54.55 
 
 		 349 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.099232  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  43.11 
 
 		 386 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03264  DNA polymerase IV  43.27 
 
 		 372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  44.57 
 
 		 352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37100  DNA polymerase IV  45.87 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0951  DNA polymerase IV  47.33 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126406  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3784  DNA-directed DNA polymerase  43.7 
 
 		 352 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.466948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1342  DNA polymerase IV  42.49 
 
 		 359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  40.47 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  42.52 
 
 		 466 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>