102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0309 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  100 
 
 
352 aa  686    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  38.44 
 
 
374 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  37.69 
 
 
372 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  34.52 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  33.13 
 
 
373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  34.27 
 
 
334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  36.21 
 
 
278 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  29 
 
 
345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  33.02 
 
 
342 aa  112  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  32.96 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  30.51 
 
 
345 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  29.75 
 
 
339 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  31.08 
 
 
328 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  32.98 
 
 
339 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  28.47 
 
 
348 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  30.8 
 
 
346 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  29.51 
 
 
348 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  29.51 
 
 
348 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  28.98 
 
 
320 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  24.56 
 
 
338 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  31.77 
 
 
342 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  30.3 
 
 
330 aa  96.3  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  27.74 
 
 
347 aa  95.9  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  30.36 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  26.71 
 
 
347 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  30.3 
 
 
330 aa  93.2  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  29.74 
 
 
318 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  29.74 
 
 
318 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  30.45 
 
 
332 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  28.37 
 
 
410 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  27.24 
 
 
318 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  31.06 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  28.79 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  27.67 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  28.57 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  27.35 
 
 
546 aa  76.3  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  25.36 
 
 
568 aa  76.3  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  26.67 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  27.54 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  26.3 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  27.66 
 
 
476 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  26.98 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  27.01 
 
 
439 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  27.87 
 
 
464 aa  74.3  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  29.24 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  28.46 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  28.84 
 
 
569 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  23.08 
 
 
543 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  24.26 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  25 
 
 
600 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  25 
 
 
600 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  23.48 
 
 
545 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  33.97 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  26.5 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001493  hypothetical protein  25.64 
 
 
339 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  28.23 
 
 
605 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  19.93 
 
 
341 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  24.61 
 
 
376 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  26.09 
 
 
607 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  25.61 
 
 
565 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  23.99 
 
 
430 aa  57.4  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.35 
 
 
382 aa  57.4  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  27.6 
 
 
433 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11451  putative dienelactone hydrolase  31.65 
 
 
550 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.127334  normal  0.338208 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  24.8 
 
 
449 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  27.88 
 
 
568 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  27.54 
 
 
498 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0371  putative lipoprotein signal peptide  40.28 
 
 
146 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  36.97 
 
 
309 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  24.36 
 
 
551 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  23.26 
 
 
572 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  23.08 
 
 
601 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  23.26 
 
 
572 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0706  fused serine peptidase/N-terminal uncharacterized domain protein  30.25 
 
 
490 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.358194  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1868  Triacylglycerol lipase  30.84 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.021332  normal  0.0911205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  32.43 
 
 
309 aa  49.3  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  27.19 
 
 
498 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  26.62 
 
 
449 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15401  putative dienelactone hydrolase  28.81 
 
 
531 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  30.25 
 
 
547 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  23.19 
 
 
542 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  30.65 
 
 
533 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  34.21 
 
 
322 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.46 
 
 
350 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  36 
 
 
322 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.46 
 
 
350 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 
254 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  22.9 
 
 
571 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  35.48 
 
 
319 aa  46.2  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  32.69 
 
 
410 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  37.1 
 
 
324 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1961  hypothetical protein  27 
 
 
524 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  26.7 
 
 
567 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  24.42 
 
 
384 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  35.48 
 
 
324 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.56 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.57 
 
 
361 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  25.28 
 
 
467 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  36.44 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  25.45 
 
 
526 aa  43.5  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>