More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1992 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  100 
 
 		 426 aa  858    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  56.34 
 
 		 410 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  57.18 
 
 		 372 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  57.46 
 
 		 370 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  55.99 
 
 		 374 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  55.99 
 
 		 370 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  54.32 
 
 		 369 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  54.68 
 
 		 369 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  55.64 
 
 		 370 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.24 
 
 		 406 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  55.47 
 
 		 404 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  54.63 
 
 		 372 aa  433  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 		 366 aa  431  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  55.15 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  54.39 
 
 		 405 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.9 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.41 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.41 
 
 		 366 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  54.41 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.41 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.41 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  54.66 
 
 		 366 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  54.99 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  54.41 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.17 
 
 		 366 aa  428  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  55.72 
 
 		 367 aa  428  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.5 
 
 		 393 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  53.3 
 
 		 370 aa  426  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  55.22 
 
 		 405 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  55.22 
 
 		 405 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  54.39 
 
 		 389 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  53.9 
 
 		 409 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  55.22 
 
 		 405 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  55.72 
 
 		 367 aa  428  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  53.16 
 
 		 367 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  53.16 
 
 		 367 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  52.7 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  53.16 
 
 		 367 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  54.88 
 
 		 370 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  53.94 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  54.63 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  53.68 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  54.03 
 
 		 370 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  53.25 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  53.43 
 
 		 380 aa  414  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  53.77 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  54.01 
 
 		 384 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  54.39 
 
 		 364 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  53.04 
 
 		 381 aa  410  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  52.32 
 
 		 367 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  53.53 
 
 		 369 aa  411  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  51.83 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  51.34 
 
 		 367 aa  405  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  53.55 
 
 		 402 aa  402  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  52.46 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  49.14 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  51.58 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  48.54 
 
 		 366 aa  395  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  50.86 
 
 		 367 aa  397  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  58.87 
 
 		 365 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  51.09 
 
 		 380 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.63 
 
 		 369 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  49.51 
 
 		 366 aa  390  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  50.73 
 
 		 388 aa  391  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 376 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  50.49 
 
 		 380 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  58.91 
 
 		 366 aa  386  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  50.75 
 
 		 368 aa  385  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  49.76 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  50.73 
 
 		 366 aa  384  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  49.75 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  51.11 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  51.36 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  51.11 
 
 		 366 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  50.73 
 
 		 366 aa  384  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  50 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  51.97 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  50.49 
 
 		 375 aa  383  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  50 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  51.24 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  50.49 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  49.51 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  49.75 
 
 		 364 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  49.75 
 
 		 382 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  50 
 
 		 378 aa  378  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  49.26 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  49.51 
 
 		 364 aa  381  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  50.49 
 
 		 408 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  51.34 
 
 		 409 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.12 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  50.62 
 
 		 371 aa  378  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  49.63 
 
 		 375 aa  378  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  51.36 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  50.37 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.63 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  49.75 
 
 		 374 aa  375  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  52.23 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  50.49 
 
 		 365 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  52.58 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  51.1 
 
 		 368 aa  376  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>