91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0070 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0070  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
937 aa  1891    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1405  sugar hydrolase  33.59 
 
 
859 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.893687  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3591  glycoside hydrolase family 38  31.84 
 
 
873 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22970  alpha-mannosidase  32.87 
 
 
1054 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2236  alpha-mannosidase  32.9 
 
 
873 aa  426  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1456  glycoside hydrolase family 38  29.03 
 
 
894 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872909  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2924  alpha-mannosidase  31.43 
 
 
877 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00691  alpha-mannosidase  31.43 
 
 
877 aa  399  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.477515  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0758  alpha-mannosidase  31.06 
 
 
877 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.915503  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00680  hypothetical protein  31.43 
 
 
877 aa  399  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.613099  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2904  glycoside hydrolase family 38  31.43 
 
 
877 aa  399  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0245738  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3955  glycosyl hydrolase 38 domain protein  28.57 
 
 
896 aa  355  2.9999999999999997e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5878  Alpha-mannosidase-like protein  32.78 
 
 
900 aa  354  5e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167609  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3244  glycoside hydrolase family 38  28.09 
 
 
878 aa  347  4e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.138117  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0149  glycoside hydrolase family 38  27.95 
 
 
873 aa  279  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2851  Alpha-mannosidase  25.16 
 
 
1061 aa  190  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1715  glycoside hydrolase family 38  31.22 
 
 
1002 aa  185  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2864  Alpha-mannosidase  27.83 
 
 
1062 aa  182  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.266249 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3666  Alpha-mannosidase  23.39 
 
 
1034 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.555262  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1096  Alpha-mannosidase  21.48 
 
 
1044 aa  168  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14420  Alpha-mannosidase  24.1 
 
 
1048 aa  167  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4452  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 
1058 aa  165  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2444  glycosyl hydrolase 38 domain protein  23.86 
 
 
1034 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1587  glycoside hydrolase family protein  29.56 
 
 
832 aa  164  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1538  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 
832 aa  163  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00952426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2049  alpha-mannosidase  22.83 
 
 
1044 aa  161  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2337  alpha-mannosidase  22.03 
 
 
1044 aa  159  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3665  glycosyl hydrolase 38 domain protein  25.72 
 
 
1059 aa  157  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3192  glycosyl hydrolases 38-like  22.78 
 
 
1095 aa  155  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253204 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1489  glycoside hydrolase family protein  28.28 
 
 
897 aa  153  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1924  alpha-mannosidase  24.01 
 
 
1040 aa  149  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.831395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4232  glycosyl hydrolase 38 domain protein  23.96 
 
 
1049 aa  148  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1501  glycoside hydrolase family 38  23.7 
 
 
1076 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1720  glycoside hydrolase family protein  21.97 
 
 
1043 aa  131  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1503  glycoside hydrolase family 38  22.74 
 
 
820 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1703  putative alpha-mannosidase  24.86 
 
 
1025 aa  129  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.114569  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0652  glycosy hydrolase, family 38  29.59 
 
 
416 aa  127  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216278  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1628  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 
1032 aa  125  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4998  Alpha-mannosidase-like protein  24.25 
 
 
1408 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610774  normal  0.702636 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1758  Alpha-mannosidase  22.05 
 
 
1032 aa  112  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10661  alpha-mannosidase  26.04 
 
 
1398 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000236587  normal  0.132856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1191  glycoside hydrolase family protein  24.51 
 
 
1398 aa  111  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143545  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1434  Alpha-mannosidase  27.63 
 
 
1057 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0722  glycoside hydrolase family protein  23.38 
 
 
1022 aa  110  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0963  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 
1374 aa  107  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0981  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 
1374 aa  107  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239974  normal  0.147978 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3007  alpha-mannosidase  25.68 
 
 
1055 aa  107  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.799127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1084  glycoside hydrolase family protein  23.99 
 
 
1398 aa  105  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503572  normal  0.0341362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14830  alpha-mannosidase  27.62 
 
 
1002 aa  101  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0345511 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0948  glycoside hydrolase family protein  22.42 
 
 
1010 aa  99.8  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0697  glycosyl hydrolase 38 domain protein  26.56 
 
 
1037 aa  99.4  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.03662  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1249  glycoside hydrolase family protein  23.1 
 
 
1371 aa  99  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324048 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4705  glycoside hydrolase family 38  26.05 
 
 
1008 aa  98.2  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02936  Alpha-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13344]  22.54 
 
 
1095 aa  95.9  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0965  glycoside hydrolase family protein  21.81 
 
 
1010 aa  95.5  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.272944  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0104  Alpha-mannosidase  22.71 
 
 
1048 aa  95.1  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4785  glycoside hydrolase family 38  25.55 
 
 
1008 aa  94  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470761  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1595  glycoside hydrolase family 38  25.71 
 
 
1062 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503925  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3122  glycosyl hydrolases 38-like  22.73 
 
 
1147 aa  93.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7334  alpha-D-mannosidase  24.64 
 
 
1007 aa  93.6  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7446  alpha-D-mannosidase  25.99 
 
 
1028 aa  92.8  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0991  glycoside hydrolase family protein  23.06 
 
 
1368 aa  91.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0188  alpha-mannosidase  24.82 
 
 
1039 aa  91.3  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2861  glycoside hydrolase family 38  25.53 
 
 
1005 aa  90.5  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.985945 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2051  Alpha-mannosidase  31.88 
 
 
1063 aa  90.1  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83621  Glycoside hydrolase, family 38 vacuolar alpha mannosidase  21.65 
 
 
1113 aa  89.4  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0841  alpha-mannosidase 2c1  25.09 
 
 
1022 aa  89  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0189  alpha-mannosidase  24.35 
 
 
1046 aa  87.4  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.398697  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5104  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 
1378 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0747946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1345  glycoside hydrolase family 38  23.13 
 
 
1465 aa  86.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326956  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15000  alpha-mannosidase  19.59 
 
 
870 aa  85.5  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303353  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1289  Alpha-mannosidase  21.18 
 
 
976 aa  85.9  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.891323  normal  0.0327923 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0848  glycosy hydrolase family protein  24.28 
 
 
1022 aa  85.1  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.553553  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5578  alpha-mannosidase  24.27 
 
 
1022 aa  84.3  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1049  glycosyl hydrolase family 38 N-terminal domain protein  24.49 
 
 
1044 aa  84  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2136  glycoside hydrolase family 38  26.2 
 
 
1003 aa  81.6  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5005  MAN2C1 protein-like protein  24.22 
 
 
1004 aa  80.1  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457974  normal  0.47837 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06750  alpha-mannosidase, putative  24.76 
 
 
1147 aa  79  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.854831  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0803  glycoside hydrolase family protein  22.59 
 
 
1008 aa  79  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.462233  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2999  glycoside hydrolase family 38  25.12 
 
 
1235 aa  77.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2525  glycoside hydrolase family 38  27.77 
 
 
711 aa  76.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000592255  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0920  glycoside hydrolase family 38  22.97 
 
 
1009 aa  76.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0644  glycosyl hydrolases 38-like  21.72 
 
 
1168 aa  75.5  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.211348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2258  Alpha-mannosidase  23.06 
 
 
1020 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10940  alpha-mannosidase  23.19 
 
 
1032 aa  73.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00976973  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0811  Alpha-mannosidase  23.68 
 
 
1020 aa  72  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2057  Alpha-mannosidase  24.13 
 
 
1042 aa  68.2  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.196818  normal  0.623087 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1011  glycoside hydrolase family protein  18.65 
 
 
988 aa  67.4  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0892535  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0191  alpha-mannosidase  25.82 
 
 
958 aa  66.6  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.690014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3715  glycoside hydrolase family 38  31.97 
 
 
831 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.409342 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52248  alpha mannosidase  29.45 
 
 
173 aa  48.9  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>