55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3127 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  100 
 
 
409 aa  795    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  95.35 
 
 
409 aa  734    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  54.98 
 
 
411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  39.67 
 
 
508 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  36.9 
 
 
554 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  36.36 
 
 
645 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  38.27 
 
 
180 aa  106  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  22.99 
 
 
458 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3841  FHA domain-containing protein  34.54 
 
 
681 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388095  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  35.71 
 
 
541 aa  103  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  41.83 
 
 
470 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  23.87 
 
 
397 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  30.27 
 
 
604 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  28.87 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1468  FHA domain-containing protein  31.78 
 
 
777 aa  87.4  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637253  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  29.09 
 
 
398 aa  87  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  28.42 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26770  hypothetical protein  30.9 
 
 
565 aa  84.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3006  FHA domain-containing protein  29.26 
 
 
572 aa  83.2  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  23.69 
 
 
453 aa  81.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  31.55 
 
 
580 aa  81.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000372597 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  40.7 
 
 
463 aa  79.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  35.37 
 
 
397 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  26.45 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0393  FHA domain-containing protein  27.96 
 
 
478 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.280068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0442  FHA domain-containing protein  27.96 
 
 
478 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1597  FHA domain-containing protein  30.92 
 
 
485 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177216  normal  0.583797 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1773  FHA domain-containing protein  27.96 
 
 
478 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701606  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1588  FHA domain-containing protein  27.96 
 
 
478 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.786308  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2846  FHA domain-containing protein  27.96 
 
 
478 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2971  FHA domain-containing protein  27.96 
 
 
477 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0249  FHA domain-containing protein  30 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1210  FHA domain-containing protein  27.96 
 
 
478 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  35.92 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
480 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  24.88 
 
 
436 aa  57  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  28.97 
 
 
433 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  21.91 
 
 
406 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  33.1 
 
 
453 aa  53.5  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1179  putative type VI secretion protein VasC-1  39.13 
 
 
314 aa  53.1  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118714  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2335  FHA domain-containing protein  34.04 
 
 
108 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1106  hypothetical protein  22.17 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1225  hypothetical protein  22.17 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.728798 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6044  forkhead-type phosphopeptide-binding protein  31.76 
 
 
419 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  23.4 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1075  FHA domain containing protein  23.23 
 
 
406 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1340  FHA domain containing protein  31.65 
 
 
1481 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000482436 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1526  FHA domain-containing protein  27.68 
 
 
398 aa  47  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0391  FHA domain-containing protein  25.15 
 
 
438 aa  46.6  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0318  FHA domain-containing protein  25.15 
 
 
438 aa  46.6  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3938  FHA domain-containing protein  33.07 
 
 
529 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  35.79 
 
 
851 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000432  uncharacterized protein ImpI/VasC  23.11 
 
 
497 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.23 
 
 
606 aa  42.7  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.17 
 
 
838 aa  42.7  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>