More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2615 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  98.66 
 
 
523 aa  1040    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  60.84 
 
 
526 aa  647    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  100 
 
 
523 aa  1056    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  58.71 
 
 
529 aa  630  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  58.24 
 
 
533 aa  623  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  55.64 
 
 
659 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  55.53 
 
 
638 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  53.73 
 
 
657 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  54.01 
 
 
627 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  56.45 
 
 
663 aa  571  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  54.31 
 
 
532 aa  550  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  41.67 
 
 
587 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  41.63 
 
 
558 aa  398  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  41.05 
 
 
555 aa  393  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.19 
 
 
607 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.04 
 
 
605 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  38.98 
 
 
520 aa  360  3e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  36.33 
 
 
619 aa  306  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  33.98 
 
 
582 aa  281  3e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  35.77 
 
 
504 aa  259  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  33.45 
 
 
581 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.88 
 
 
601 aa  249  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  33 
 
 
508 aa  249  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  35.07 
 
 
625 aa  248  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  34.68 
 
 
641 aa  242  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  34.86 
 
 
637 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  34.68 
 
 
637 aa  225  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0478  putative 5`-nucleotidase  30.5 
 
 
580 aa  221  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000584896  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  31.25 
 
 
591 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3317  5'-nucleotidase, putative  30.31 
 
 
583 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1224  metallophosphoesterase  29.93 
 
 
583 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.618653  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.81 
 
 
672 aa  218  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1294  metallophosphoesterase  29.66 
 
 
583 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260824  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1223  metallophosphoesterase  29.48 
 
 
583 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  30.14 
 
 
607 aa  216  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2657  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.05 
 
 
581 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2370  5'-nucleotidase, putative  28.74 
 
 
573 aa  213  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.405664 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3010  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.36 
 
 
581 aa  213  9e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1368  metallophosphoesterase  27.85 
 
 
580 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198191  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2995  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.61 
 
 
581 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1300  5'-nucleotidase  27.78 
 
 
592 aa  210  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.291258  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3153  5'-nucleotidase domain protein  26.97 
 
 
581 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867594 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0450  5'-nucleotidase  27.45 
 
 
579 aa  209  9e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000189  5'-nucleotidase  28.79 
 
 
578 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000310598  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  31.26 
 
 
523 aa  206  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1235  5'-Nucleotidase domain protein  32.79 
 
 
613 aa  206  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.798144  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05914  5'-nucleotidase  28.31 
 
 
585 aa  206  9e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43694  predicted protein  31.58 
 
 
663 aa  205  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553489  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  29.1 
 
 
580 aa  204  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1111  metallophosphoesterase  27.05 
 
 
578 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.443136  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  28.55 
 
 
584 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1285  5'-nucleotidase  29.85 
 
 
586 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1539  metallophosphoesterase  28.22 
 
 
577 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.337659 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  31.05 
 
 
515 aa  197  6e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  27.01 
 
 
581 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  34.9 
 
 
512 aa  193  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  30.39 
 
 
1215 aa  193  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  30 
 
 
1202 aa  193  7e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  32.1 
 
 
508 aa  192  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  32.1 
 
 
508 aa  192  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.92 
 
 
509 aa  192  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  29 
 
 
529 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  28.81 
 
 
529 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  29 
 
 
529 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  28.62 
 
 
664 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  33.19 
 
 
1175 aa  187  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  28.65 
 
 
529 aa  186  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  28.65 
 
 
529 aa  186  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  28.65 
 
 
529 aa  186  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  28.65 
 
 
529 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  29 
 
 
529 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  32.9 
 
 
1181 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.81 
 
 
529 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  28.51 
 
 
515 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.81 
 
 
517 aa  182  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  28.44 
 
 
529 aa  182  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0854  5'-Nucleotidase domain protein  30.61 
 
 
619 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192901  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0825  5'-Nucleotidase domain protein  30.61 
 
 
619 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  31.14 
 
 
772 aa  179  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  31.14 
 
 
772 aa  179  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1750  5'-nucleotidase  31.72 
 
 
500 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.398789 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  31.5 
 
 
503 aa  176  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1464  5'-Nucleotidase domain protein  30.82 
 
 
657 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577619  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1472  5'-nucleotidase  31.51 
 
 
505 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.092078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3844  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.23 
 
 
712 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.96 
 
 
518 aa  174  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.24 
 
 
530 aa  174  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  28.96 
 
 
518 aa  174  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  28.77 
 
 
518 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  28.57 
 
 
518 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.77 
 
 
518 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  26.09 
 
 
530 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  28.69 
 
 
504 aa  167  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.26 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  29.44 
 
 
539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  26.67 
 
 
529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  27.32 
 
 
529 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  31.01 
 
 
520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2625  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.08 
 
 
572 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00121677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2583  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.48 
 
 
572 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.832194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>