More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2208 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2208  Holliday junction resolvase  100 
 
 
168 aa  332  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147946  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0556  Holliday junction resolvase  98.81 
 
 
168 aa  327  4e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.657324  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1230  Holliday junction resolvase  96.82 
 
 
168 aa  278  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  74.03 
 
 
164 aa  232  2e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0964  Holliday junction resolvase  69.94 
 
 
191 aa  219  2e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1103  Holliday junction resolvase  75.78 
 
 
176 aa  218  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.788041  normal  0.52984 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2373  Holliday junction resolvase  68.35 
 
 
188 aa  209  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.511513 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  61.44 
 
 
167 aa  184  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  57.06 
 
 
168 aa  179  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3512  Holliday junction resolvase  60.61 
 
 
169 aa  178  3e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658473  normal  0.710668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3217  Holliday junction resolvase  61.21 
 
 
169 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.571528 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3604  Holliday junction resolvase  60.61 
 
 
169 aa  171  4e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.758164  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1647  Holliday junction resolvase  58.93 
 
 
173 aa  171  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2639  Holliday junction resolvase  58.18 
 
 
167 aa  168  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1211  Holliday junction resolvase  60.26 
 
 
172 aa  168  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1704  Holliday junction resolvase  58.33 
 
 
173 aa  167  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.723247  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  56.25 
 
 
175 aa  167  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.335061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3179  Holliday junction resolvase  60.9 
 
 
171 aa  163  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1087  Holliday junction resolvase  58.08 
 
 
169 aa  162  2e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109065  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.21 
 
 
158 aa  162  2e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4170  Holliday junction resolvase  59.88 
 
 
232 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0285  Holliday junction resolvase  62.89 
 
 
189 aa  161  4e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2726  Holliday junction resolvase  59.24 
 
 
172 aa  160  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4272  Holliday junction resolvase  59.88 
 
 
198 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0821163  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3523  Holliday junction resolvase  60.13 
 
 
178 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6909  Holliday junction resolvase  61.29 
 
 
175 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.293196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0004  Holliday junction resolvase  58.78 
 
 
175 aa  156  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  2.81167e-06  normal  0.194479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1289  Holliday junction resolvase  61.11 
 
 
174 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4806  Holliday junction resolvase  60.13 
 
 
175 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0002  Holliday junction resolvase  60.31 
 
 
176 aa  154  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2328  Holliday junction resolvase  63.4 
 
 
217 aa  154  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0343755  normal  0.15621 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  54.36 
 
 
169 aa  154  5e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  52.94 
 
 
156 aa  149  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0926  Holliday junction resolvase  58.44 
 
 
189 aa  148  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.66838  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0962  Holliday junction resolvase  58.44 
 
 
189 aa  148  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00555421 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0902  Holliday junction resolvase  60.39 
 
 
189 aa  147  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.577145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2906  Holliday junction resolvase  54.94 
 
 
167 aa  147  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  55.13 
 
 
182 aa  146  1e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  51.3 
 
 
164 aa  144  7e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2141  Holliday junction resolvase  52.87 
 
 
165 aa  144  8e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  48.82 
 
 
180 aa  143  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  51.3 
 
 
164 aa  143  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  51.95 
 
 
176 aa  143  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  48.21 
 
 
180 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  50.3 
 
 
182 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  53.12 
 
 
186 aa  141  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  51.5 
 
 
182 aa  141  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  53.12 
 
 
186 aa  141  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  48.45 
 
 
183 aa  139  2e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0930  Holliday junction resolvase  57.25 
 
 
207 aa  139  2e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.811793 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  48.45 
 
 
183 aa  139  2e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  47.02 
 
 
180 aa  138  4e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  47.02 
 
 
180 aa  138  4e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  47.02 
 
 
180 aa  138  4e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  47.02 
 
 
180 aa  138  4e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  50 
 
 
161 aa  138  4e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 
284 aa  137  5e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  47.02 
 
 
180 aa  138  5e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 
275 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  47.02 
 
 
180 aa  137  8e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  47.4 
 
 
164 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  47.02 
 
 
180 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  47.62 
 
 
180 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  47.62 
 
 
180 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  46.01 
 
 
164 aa  136  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.74044e-15 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  50.61 
 
 
182 aa  135  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  50.97 
 
 
184 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  45.34 
 
 
171 aa  135  3e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.23238e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  44.64 
 
 
168 aa  135  3e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  47.62 
 
 
180 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  45.35 
 
 
172 aa  134  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  47.47 
 
 
183 aa  134  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  43.87 
 
 
173 aa  134  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  48.37 
 
 
180 aa  131  4e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  48.8 
 
 
183 aa  131  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  48.37 
 
 
180 aa  130  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  47.9 
 
 
182 aa  130  1e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.28 
 
 
183 aa  129  2e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  42.41 
 
 
162 aa  128  4e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  46.45 
 
 
159 aa  128  4e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.83978e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.97 
 
 
173 aa  127  7e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  46.63 
 
 
181 aa  127  1e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  45.7 
 
 
173 aa  126  1e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.86785e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  46.25 
 
 
181 aa  127  1e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  46.05 
 
 
181 aa  125  2e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  44.74 
 
 
181 aa  125  2e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  45.7 
 
 
180 aa  125  2e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0784  Holliday junction resolvase  50.66 
 
 
169 aa  125  2e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193363  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  44.74 
 
 
181 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45 
 
 
163 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3409  Holliday junction resolvase  45.45 
 
 
182 aa  124  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102403  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1083  Holliday junction resolvase  47.4 
 
 
182 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00107185  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  43.64 
 
 
165 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  40.52 
 
 
182 aa  123  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  43.23 
 
 
173 aa  123  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  44.3 
 
 
173 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  45.16 
 
 
180 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  42.95 
 
 
173 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.29 
 
 
173 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.51 
 
 
165 aa  120  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>