39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0010 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0010  Fimbrial protein  100 
 
 		 319 aa  651    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0010  Fimbrial protein  92.48 
 
 		 319 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1343  Fimbrial protein  44.72 
 
 		 315 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259111  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69760  putative fimbrial protein  37.66 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0511825  normal  0.411103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4025  fimbrial protein  32.26 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.355446 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  33.45 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6640  fimbrial protein  28.62 
 
 		 318 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447531  hitchhiker  0.00000000139123 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3816  Fimbrial protein  37.27 
 
 		 222 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351886 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3929  Fimbrial protein  37.27 
 
 		 222 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0836  Fimbrial protein  35.57 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.252785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0765  Fimbrial protein  34.62 
 
 		 209 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.146412  normal  0.0127423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  32.14 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1678  fimbrial family protein  27.94 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1789  fimbrial protein  27.94 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00112621  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  32.35 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  31.76 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  31.76 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3037  fimbrial protein  28.48 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130146  normal  0.538691 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  31.76 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1150  putative fimbrial protein  24.61 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  30.95 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  26.21 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  25.85 
 
 		 179 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  25.85 
 
 		 179 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  28.03 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  29.14 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1454  fimbrial protein  26.17 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2234  fimbrial protein  26.76 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.22557  normal  0.0194534 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  24.83 
 
 		 183 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  23.65 
 
 		 180 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  29.22 
 
 		 176 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  27.27 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  28.42 
 
 		 183 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  30.71 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1697  fimbrial protein  28.9 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  27.09 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  29.22 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  27.08 
 
 		 340 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  25.85 
 
 		 185 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>