More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1119 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  100 
 
 		 432 aa  857    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  82.07 
 
 		 457 aa  708    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2615  peptidase S41  51.58 
 
 		 427 aa  358  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  45.66 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  39.64 
 
 		 465 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  41.44 
 
 		 482 aa  264  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  40.1 
 
 		 483 aa  256  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  28.53 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  28.75 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  28.75 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  27.65 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  27.81 
 
 		 447 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  25.77 
 
 		 427 aa  120  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  25 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  27.89 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  27.53 
 
 		 430 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  27.57 
 
 		 429 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  27.74 
 
 		 430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  26.26 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  25.63 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  31.59 
 
 		 507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  32.91 
 
 		 498 aa  114  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  25.33 
 
 		 440 aa  113  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  27.25 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  27.04 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  27.27 
 
 		 427 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 496 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 496 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  27.32 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  26.89 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  27.14 
 
 		 413 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  27.91 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  28.29 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  24.41 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  26.25 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  30.51 
 
 		 438 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  27.12 
 
 		 421 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  27.6 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  30.67 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  28.74 
 
 		 1090 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  30.67 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  27.78 
 
 		 446 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  31.25 
 
 		 484 aa  100  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  25.75 
 
 		 412 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  26.36 
 
 		 453 aa  99.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  27.37 
 
 		 438 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  28.11 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  29.25 
 
 		 488 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  29.33 
 
 		 389 aa  99  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  27.21 
 
 		 1067 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  28.8 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  27.37 
 
 		 437 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  27.9 
 
 		 457 aa  97.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  24.86 
 
 		 430 aa  97.4  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  30.95 
 
 		 436 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  30.95 
 
 		 436 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  26.8 
 
 		 417 aa  97.1  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  24.16 
 
 		 434 aa  96.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0414  carboxyl-terminal protease  33.53 
 
 		 416 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  27.76 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  27.54 
 
 		 443 aa  96.3  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  30.17 
 
 		 468 aa  95.5  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  27.82 
 
 		 1082 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4004  carboxyl-terminal protease  32.57 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  27.37 
 
 		 427 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  29.78 
 
 		 457 aa  94.4  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  30.51 
 
 		 440 aa  94.4  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  25.5 
 
 		 416 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  27.12 
 
 		 450 aa  93.6  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  26.85 
 
 		 491 aa  94  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  26.47 
 
 		 418 aa  93.6  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  26.15 
 
 		 401 aa  93.6  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  29.55 
 
 		 379 aa  93.6  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  23.46 
 
 		 444 aa  93.2  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46670  predicted protein  27.95 
 
 		 476 aa  93.2  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  26.55 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  29.73 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  26.48 
 
 		 407 aa  92.8  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  28.33 
 
 		 440 aa  92.8  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  24.5 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  24.5 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  23.74 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  26.87 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  32.23 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  24.02 
 
 		 444 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  23.64 
 
 		 434 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  32.79 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  25.96 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  25.06 
 
 		 450 aa  90.5  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  28.31 
 
 		 383 aa  90.1  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  27.08 
 
 		 439 aa  90.1  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3061  predicted protein  25.07 
 
 		 356 aa  89.7  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  27.47 
 
 		 436 aa  90.1  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  28.38 
 
 		 424 aa  89.7  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  28.42 
 
 		 463 aa  89.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  28.71 
 
 		 444 aa  89.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  29.15 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  28.38 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  28.81 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  26.92 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>