More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4317 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  100 
 
 		 145 aa  296  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  80.69 
 
 		 145 aa  250  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  80.69 
 
 		 145 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  79.31 
 
 		 145 aa  244  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  78.62 
 
 		 145 aa  243  9e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  77.24 
 
 		 145 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  77.24 
 
 		 145 aa  237  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  72.41 
 
 		 145 aa  228  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  72.41 
 
 		 145 aa  226  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  72.41 
 
 		 149 aa  226  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  70.14 
 
 		 145 aa  223  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  71.72 
 
 		 145 aa  222  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  69.44 
 
 		 145 aa  222  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  69.44 
 
 		 145 aa  219  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  68.75 
 
 		 145 aa  220  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  68.75 
 
 		 145 aa  220  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  68.06 
 
 		 145 aa  218  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  68.06 
 
 		 145 aa  215  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  59.72 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  59.59 
 
 		 162 aa  190  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  61.7 
 
 		 152 aa  190  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  55.17 
 
 		 146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  56.55 
 
 		 157 aa  179  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  59.57 
 
 		 155 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  54.61 
 
 		 163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  53.1 
 
 		 145 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.9 
 
 		 163 aa  170  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  52.08 
 
 		 145 aa  169  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  52.78 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.19 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.41 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  52.41 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  52.48 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  53.28 
 
 		 143 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  52.11 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  55.32 
 
 		 155 aa  156  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  53.1 
 
 		 151 aa  155  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.06 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  47.22 
 
 		 153 aa  153  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.94 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  47.89 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  51.72 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  48.23 
 
 		 154 aa  149  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  49.66 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  49.66 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  42.66 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  52.14 
 
 		 167 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  50.71 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  43.45 
 
 		 159 aa  146  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  43.45 
 
 		 159 aa  146  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.3 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.08 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  47.59 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.66 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  41.26 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  48.59 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.29 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.76 
 
 		 159 aa  141  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.26 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.71 
 
 		 163 aa  141  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.39 
 
 		 151 aa  141  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  44.83 
 
 		 159 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  42.07 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.62 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 		 159 aa  139  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.14 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.14 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  44.14 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  43.45 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.84 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  49.61 
 
 		 151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  51.08 
 
 		 144 aa  137  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.38 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  47.59 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.21 
 
 		 150 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  44.37 
 
 		 150 aa  136  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  47.18 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  46.48 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  48.25 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  42.45 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.31 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  44.37 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  45.07 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  45.71 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.07 
 
 		 147 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.31 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  43.57 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  44.68 
 
 		 158 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.84 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 		 159 aa  130  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.31 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  47.18 
 
 		 149 aa  130  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2565  alkylhydroperoxidase AhpD core  58.65 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.929389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  44.68 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.84 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.38 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.14 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  43.88 
 
 		 167 aa  127  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>