228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4084 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  75.8 
 
 		 483 aa  704    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  77.35 
 
 		 485 aa  738    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  77.04 
 
 		 485 aa  732    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  100 
 
 		 486 aa  984    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  65.97 
 
 		 470 aa  632  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  71.33 
 
 		 480 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  71.2 
 
 		 478 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  61.05 
 
 		 478 aa  537  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  60.12 
 
 		 509 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  60.49 
 
 		 557 aa  511  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  60.12 
 
 		 479 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  60.12 
 
 		 577 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  60.04 
 
 		 476 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  60.04 
 
 		 476 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  60.04 
 
 		 476 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  55.7 
 
 		 464 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  55.26 
 
 		 467 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  55.7 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  54.49 
 
 		 466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  53.39 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  52.74 
 
 		 467 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  52.74 
 
 		 467 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  52.74 
 
 		 467 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  52.74 
 
 		 467 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  52.95 
 
 		 467 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  52.95 
 
 		 467 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  52.74 
 
 		 467 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  50.83 
 
 		 518 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  52.63 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  55.02 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  55.24 
 
 		 471 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  39.92 
 
 		 505 aa  295  9e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  39.88 
 
 		 616 aa  293  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  39.76 
 
 		 532 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  36.83 
 
 		 565 aa  287  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  37.72 
 
 		 545 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  37.72 
 
 		 545 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  37.72 
 
 		 545 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  37.54 
 
 		 545 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  38 
 
 		 546 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  39.16 
 
 		 527 aa  282  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  37.83 
 
 		 546 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  36.8 
 
 		 545 aa  280  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  37.65 
 
 		 546 aa  279  9e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  39.07 
 
 		 543 aa  278  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  38.63 
 
 		 640 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  37.55 
 
 		 527 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  37.87 
 
 		 499 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  38.53 
 
 		 496 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  38.74 
 
 		 496 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  37.95 
 
 		 498 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  38.16 
 
 		 498 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  38.16 
 
 		 498 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  39.23 
 
 		 548 aa  267  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  37.91 
 
 		 543 aa  266  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  37.27 
 
 		 527 aa  265  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  37.25 
 
 		 552 aa  265  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  37.53 
 
 		 498 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  37.53 
 
 		 501 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  37.53 
 
 		 498 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  37.53 
 
 		 498 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  38.16 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  36.65 
 
 		 501 aa  260  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  35.21 
 
 		 568 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  37.85 
 
 		 535 aa  243  7e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  33.39 
 
 		 568 aa  226  9e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  35.6 
 
 		 455 aa  216  9e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  36.35 
 
 		 565 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  35.74 
 
 		 576 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  38.7 
 
 		 388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  36.96 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  37.07 
 
 		 434 aa  194  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  32.31 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  33.74 
 
 		 671 aa  191  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  33.55 
 
 		 589 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  37 
 
 		 541 aa  177  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  31.76 
 
 		 436 aa  176  8e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  36.05 
 
 		 547 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  31.64 
 
 		 584 aa  167  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  33.63 
 
 		 536 aa  164  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1253  alkaline phosphatase  35.21 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  29.92 
 
 		 584 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4466  alkaline phosphatase  30.99 
 
 		 499 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4297  alkaline phosphatase  30.99 
 
 		 499 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4197  alkaline phosphatase  30.99 
 
 		 499 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  30.65 
 
 		 581 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  30.34 
 
 		 609 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  31.51 
 
 		 557 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886968 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  31.51 
 
 		 557 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  31.51 
 
 		 557 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82654  vacuolar alkaline phosphatase  34.53 
 
 		 560 aa  160  5e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.134835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  31.12 
 
 		 582 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  34.25 
 
 		 525 aa  159  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1376  alkaline phosphatase  35.69 
 
 		 558 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0116315  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  30.3 
 
 		 589 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  33.84 
 
 		 557 aa  159  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2738  alkaline phosphatase  35.31 
 
 		 557 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.133398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  33.85 
 
 		 548 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  35.54 
 
 		 525 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  30.71 
 
 		 581 aa  156  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>