241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0990 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  100 
 
 		 351 aa  726    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  67.52 
 
 		 351 aa  513  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  62.96 
 
 		 351 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  62.96 
 
 		 351 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  62.22 
 
 		 351 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  60.11 
 
 		 351 aa  463  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  60.34 
 
 		 353 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  58.91 
 
 		 353 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  59.09 
 
 		 353 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  57.26 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  56.98 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  56.45 
 
 		 348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  55.59 
 
 		 350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  57.88 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  58.45 
 
 		 348 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  58.17 
 
 		 348 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  57.88 
 
 		 348 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  56.13 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  51.29 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  54 
 
 		 348 aa  368  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  53.56 
 
 		 351 aa  371  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  51 
 
 		 353 aa  361  8e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  51.42 
 
 		 357 aa  358  8e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  49 
 
 		 357 aa  339  5e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  49.28 
 
 		 349 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  50 
 
 		 359 aa  337  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  48.96 
 
 		 343 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  37.78 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  37.5 
 
 		 357 aa  228  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  35.8 
 
 		 363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  33.92 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  32.87 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  28.98 
 
 		 344 aa  149  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 355 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 355 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 355 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 360 aa  145  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  31.97 
 
 		 376 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  28.53 
 
 		 356 aa  143  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  28.53 
 
 		 356 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  31.17 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  28.61 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  32.43 
 
 		 365 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 353 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  30.91 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  29.97 
 
 		 360 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  30.36 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  31.9 
 
 		 418 aa  123  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 363 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  28.73 
 
 		 366 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  26.54 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  27.51 
 
 		 356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  27.67 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  37.19 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  37.84 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 276 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1069  hypothetical protein  39.53 
 
 		 140 aa  57  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  25.54 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.86 
 
 		 293 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 444 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 439 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 275 aa  52.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  23.49 
 
 		 205 aa  52  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  31.13 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 234 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 267 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0566  methyltransferase, putative  29.13 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 271 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  25.57 
 
 		 287 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  26.79 
 
 		 247 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 286 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 250 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  27.36 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 283 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 261 aa  49.7  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.73 
 
 		 447 aa  49.7  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  29.45 
 
 		 232 aa  49.7  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  21.99 
 
 		 346 aa  49.7  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 283 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  30.97 
 
 		 274 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  27.19 
 
 		 242 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 239 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1633  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.53 
 
 		 431 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00552168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>