203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2747 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  100 
 
 
195 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  84.1 
 
 
195 aa  345  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  56.99 
 
 
201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  53.4 
 
 
200 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  52.85 
 
 
200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  51.81 
 
 
200 aa  184  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  50.52 
 
 
203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  48.97 
 
 
193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  49.48 
 
 
199 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  48.45 
 
 
193 aa  176  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  40.8 
 
 
202 aa  115  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  34.72 
 
 
199 aa  112  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  38.22 
 
 
192 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  40.82 
 
 
199 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  39.72 
 
 
195 aa  101  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  34.59 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  34.13 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  32.1 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  33.53 
 
 
1287 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  32.6 
 
 
214 aa  85.1  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  32.6 
 
 
214 aa  85.1  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  35.46 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  29.56 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  30.5 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  32.57 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  36.3 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  32.75 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  36.05 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  33.5 
 
 
440 aa  69.3  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  32.24 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  27 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  31.55 
 
 
211 aa  67.8  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  33.93 
 
 
208 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  33.54 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  33.11 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  40.2 
 
 
250 aa  64.7  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  36.3 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  31.55 
 
 
218 aa  62.8  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  29.66 
 
 
236 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  29.66 
 
 
236 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  28.97 
 
 
222 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  29.66 
 
 
236 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  29.66 
 
 
236 aa  62  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  29.66 
 
 
236 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  29.66 
 
 
236 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  29.14 
 
 
202 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  29.83 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  28.77 
 
 
236 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  28.57 
 
 
236 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  29.28 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  27.62 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  28.69 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  26.9 
 
 
236 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  31.02 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.29 
 
 
224 aa  52.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1553  tellurite resistance protein TehB  27.97 
 
 
198 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000397  SAM-dependent methyltransferase  29.03 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
222 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  26.67 
 
 
295 aa  52  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  26.67 
 
 
295 aa  52  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  26.67 
 
 
295 aa  52  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  25.6 
 
 
198 aa  52  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  30.9 
 
 
257 aa  51.6  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  34.17 
 
 
222 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  27.56 
 
 
242 aa  51.6  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  33.78 
 
 
220 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1657  tellurite resistance protein TehB  28.81 
 
 
197 aa  51.2  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2217  tellurite resistance protein TehB  28.81 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1745  tellurite resistance protein TehB  28.81 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000325665  hitchhiker  3.84687e-20 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  32.86 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  28.81 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 
197 aa  50.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1113  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
226 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
250 aa  49.7  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  27.27 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  28.81 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  27.27 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  27.27 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  27.27 
 
 
198 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  28.57 
 
 
201 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 
551 aa  48.5  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 
218 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.12 
 
 
203 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  28.57 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>