60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1981 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  92.61 
 
 		 203 aa  380  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  59.89 
 
 		 204 aa  221  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  54.7 
 
 		 204 aa  202  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  49.25 
 
 		 209 aa  194  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  47.74 
 
 		 200 aa  179  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  47.24 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  41.87 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  38.42 
 
 		 213 aa  124  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  35.06 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  41.12 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  34.07 
 
 		 378 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  35.67 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  37.04 
 
 		 200 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  40 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  32.72 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  31.02 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  31.68 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  31.68 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  31.76 
 
 		 211 aa  88.2  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  31.98 
 
 		 398 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  29.65 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  32.98 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  31.79 
 
 		 390 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  26.6 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  26.6 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  32.93 
 
 		 367 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  31.75 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  32.04 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  31.49 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  31.43 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  31.58 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  29.51 
 
 		 369 aa  71.2  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  26.53 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  27.65 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  26.21 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2314  hypothetical protein  24.86 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  20.79 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2345  putative lipoprotein  23.84 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.623027  normal  0.0122599 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  23.2 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  23.65 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  25.62 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  24.14 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  27.15 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  29.5 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  24.14 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  23.28 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  22.41 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3567  hypothetical protein  29.77 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.690462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  25.82 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1194  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  23.74 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907024  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0375  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  25.42 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  27.54 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  27.8 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  23.91 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2009  putative lipoprotein  25.41 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  27.72 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1032  ABC transporter substrate-binding protein  35.42 
 
 		 101 aa  42.4  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  27.54 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1821  putative lipoprotein  26.34 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>