41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3914 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3914  putative lipoprotein  100 
 
 		 234 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.28345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0233  putative lipoprotein  53.78 
 
 		 237 aa  208  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0309  putative lipoprotein  47.39 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0253  putative lipoprotein  50 
 
 		 225 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0247  protein of unknown function DUF330  49.35 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.661362  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0185  putative lipoprotein  49.78 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0923  putative lipoprotein  47.18 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0368  putative lipoprotein  50.72 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0296  protein of unknown function DUF330  50.62 
 
 		 227 aa  141  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4222  hypothetical protein  37.12 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0098  lipoprotein  34.63 
 
 		 208 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1209  putative lipoprotein  41.67 
 
 		 201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  40.61 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  36.11 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  38.16 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0171  putative lipoprotein  37.56 
 
 		 221 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0178  protein of unknown function DUF330  37.63 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  36.71 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  36.71 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  36.71 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  37.68 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  36.71 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  37.68 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  37.81 
 
 		 210 aa  99.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0069  hypothetical protein  33.02 
 
 		 215 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  35.15 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  36.46 
 
 		 217 aa  96.3  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  34.82 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2947  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  32.75 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2907  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  34.83 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2809  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  34.57 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.357609 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2898  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  34.83 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2283  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  34.83 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2369  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.727171 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0208  hypothetical protein  35.83 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0171  putative lipoprotein  31.41 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1793  hypothetical protein  30.92 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2134  lipoprotein, putative  30.92 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2274  protein of unknown function DUF330  29.84 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0099  protein of unknown function DUF330  24.51 
 
 		 198 aa  52.8  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1525  hypothetical protein  20.28 
 
 		 198 aa  42.4  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00769355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>