More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6281 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6281  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
242 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1543  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.72 
 
 
264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.174078  normal  0.0303044 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3763  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.95 
 
 
233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00874231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3670  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.09 
 
 
243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.657002 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.54 
 
 
244 aa  218  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114872  normal  0.0870756 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5588  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
243 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.68 
 
 
233 aa  215  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2585  short chain dehydrogenase  47.03 
 
 
239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3542  short chain dehydrogenase  47.88 
 
 
239 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.71416 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1195  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.31 
 
 
239 aa  208  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.821912  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3977  short chain dehydrogenase  47.03 
 
 
239 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0505376 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3453  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 
239 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5275  short chain dehydrogenase  45.76 
 
 
239 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10130  short chain dehydrogenase  46.72 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206354  normal  0.858478 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.951488  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.83 
 
 
240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.11 
 
 
240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191512  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 
239 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6985  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
240 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622765  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
244 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1924  short chain dehydrogenase  43.67 
 
 
238 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588945  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 
241 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.77 
 
 
237 aa  187  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2876  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.35 
 
 
246 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.470002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
246 aa  185  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5165  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 
238 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283409  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3238  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (3-ketoacyl- acyl carrier protein reductase)  44.14 
 
 
223 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.330191  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.69 
 
 
243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.888248  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2285  acetoacetyl-CoA reductase  42.28 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00853533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.51 
 
 
249 aa  158  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
254 aa  158  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 
224 aa  158  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6276  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
248 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
250 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
254 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  36.84 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  36.84 
 
 
246 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  36.84 
 
 
246 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  36.84 
 
 
246 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  36.84 
 
 
246 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  36.84 
 
 
246 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  36.84 
 
 
246 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0509  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.19 
 
 
245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.27 
 
 
245 aa  151  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
245 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0724281  normal  0.787081 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  36.44 
 
 
260 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2335  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.34 
 
 
253 aa  149  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
248 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961994  normal  0.547574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
257 aa  148  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136415  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.5 
 
 
233 aa  148  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  35.68 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.74 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203044  normal  0.111569 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  36.03 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2371  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase / Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  36.44 
 
 
246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.1 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  36.03 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  36.03 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
245 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  36.03 
 
 
246 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  36.03 
 
 
246 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.84 
 
 
266 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
285 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86149  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
267 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  36.03 
 
 
246 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.34 
 
 
246 aa  144  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
256 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  35.22 
 
 
246 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  36.99 
 
 
246 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
252 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.890933  normal  0.0516654 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 
233 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  36.84 
 
 
246 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
249 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00764889  hitchhiker  0.0046637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 
233 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
245 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
255 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.556744  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  34.01 
 
 
246 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000603  putative 3-oxoacyl-(acyl carrier protein) reductase  35.66 
 
 
239 aa  142  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0031423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 
233 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3072  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.91 
 
 
248 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
268 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  37.76 
 
 
242 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5119  acetoacetyl-CoA reductase  38.02 
 
 
242 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28454  normal  0.417051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
251 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
251 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1074  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.75 
 
 
249 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.34 
 
 
249 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0620  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.76 
 
 
250 aa  141  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.890979 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
248 aa  141  8e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.03 
 
 
245 aa  141  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.25 
 
 
251 aa  141  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2001  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.27 
 
 
245 aa  141  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  37.76 
 
 
242 aa  141  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.63 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.22 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>