More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4875 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  71.71 
 
 		 844 aa  1012    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  71.71 
 
 		 839 aa  1013    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  64.12 
 
 		 846 aa  978    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  67.9 
 
 		 846 aa  968    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  66.57 
 
 		 698 aa  908    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 850 aa  1711    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  71.71 
 
 		 839 aa  1012    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  65.64 
 
 		 743 aa  930    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  71.71 
 
 		 928 aa  1012    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  67.66 
 
 		 732 aa  923    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  66.91 
 
 		 742 aa  921    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  70.62 
 
 		 862 aa  1035    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  65.7 
 
 		 841 aa  950    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  71.71 
 
 		 844 aa  1012    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  72.06 
 
 		 857 aa  1035    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  72.4 
 
 		 787 aa  1003    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  63.37 
 
 		 678 aa  802    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  59.43 
 
 		 675 aa  810    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  68.67 
 
 		 801 aa  978    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  67.19 
 
 		 838 aa  1079    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  62.33 
 
 		 810 aa  970    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  67.19 
 
 		 821 aa  1099    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  73.39 
 
 		 826 aa  1162    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  71.01 
 
 		 858 aa  1034    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  64.94 
 
 		 743 aa  921    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  70.73 
 
 		 857 aa  1013    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  70.59 
 
 		 888 aa  1007    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  71.71 
 
 		 844 aa  1012    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  51.87 
 
 		 783 aa  655    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  71.71 
 
 		 844 aa  1012    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  61.39 
 
 		 686 aa  812    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  71.78 
 
 		 870 aa  1031    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  66.33 
 
 		 728 aa  919    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  70.73 
 
 		 857 aa  1013    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  64.94 
 
 		 743 aa  921    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  68.56 
 
 		 834 aa  1066    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  64.85 
 
 		 787 aa  932    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  68.19 
 
 		 846 aa  969    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  37.96 
 
 		 850 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  39.43 
 
 		 750 aa  462  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  38.57 
 
 		 774 aa  452  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  37.65 
 
 		 743 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  36.32 
 
 		 815 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  36.54 
 
 		 854 aa  428  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  36.34 
 
 		 740 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  35.09 
 
 		 762 aa  418  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  35.03 
 
 		 762 aa  416  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  38.4 
 
 		 755 aa  411  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  37.83 
 
 		 730 aa  412  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  35.33 
 
 		 772 aa  408  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  34.2 
 
 		 786 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  38.12 
 
 		 760 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  37.34 
 
 		 752 aa  403  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  35.05 
 
 		 786 aa  401  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  35.39 
 
 		 785 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  35.46 
 
 		 767 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  34.05 
 
 		 759 aa  399  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 		 768 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  34.49 
 
 		 765 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  35.66 
 
 		 794 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  35.19 
 
 		 907 aa  386  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  33.23 
 
 		 776 aa  369  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  33.91 
 
 		 773 aa  368  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  31.71 
 
 		 777 aa  310  8e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  34.77 
 
 		 646 aa  310  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  30.45 
 
 		 817 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  32.27 
 
 		 797 aa  304  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  30.16 
 
 		 823 aa  303  9e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  32.19 
 
 		 792 aa  301  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  30.16 
 
 		 823 aa  300  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  30.24 
 
 		 817 aa  300  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  32.41 
 
 		 648 aa  300  9e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  32.05 
 
 		 791 aa  299  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  30.66 
 
 		 748 aa  299  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  30.32 
 
 		 814 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  29.97 
 
 		 823 aa  296  8e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  30.14 
 
 		 819 aa  296  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  32.01 
 
 		 778 aa  296  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  30.34 
 
 		 804 aa  292  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  31.95 
 
 		 803 aa  286  9e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4611  peptidoglycan synthetase  30.31 
 
 		 852 aa  286  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.241075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  29.92 
 
 		 795 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  29.74 
 
 		 803 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  31.42 
 
 		 679 aa  284  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  30.19 
 
 		 793 aa  283  8.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  31.38 
 
 		 766 aa  283  8.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  33.6 
 
 		 648 aa  283  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  29.88 
 
 		 796 aa  283  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  30.19 
 
 		 797 aa  283  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  30.29 
 
 		 833 aa  281  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  31.37 
 
 		 793 aa  281  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  28.2 
 
 		 827 aa  280  8e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  30.05 
 
 		 795 aa  280  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  31 
 
 		 707 aa  280  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  33.12 
 
 		 640 aa  279  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  29.88 
 
 		 797 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  28.44 
 
 		 818 aa  278  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  33.28 
 
 		 625 aa  277  5e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  28.86 
 
 		 791 aa  277  6e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  30.13 
 
 		 786 aa  276  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>