More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2586 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  69.04 
 
 
861 aa  1146    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  66.39 
 
 
856 aa  1117    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  88.54 
 
 
855 aa  1456    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  70.09 
 
 
855 aa  1177    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  70.25 
 
 
857 aa  1216    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  43.92 
 
 
878 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  100 
 
 
856 aa  1726    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  88.54 
 
 
855 aa  1456    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  53.87 
 
 
896 aa  889    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  69.85 
 
 
865 aa  1167    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  68.07 
 
 
890 aa  1127    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  69.31 
 
 
856 aa  1188    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  70.29 
 
 
875 aa  1180    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  70.41 
 
 
861 aa  1173    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  69.94 
 
 
858 aa  1219    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  70.52 
 
 
872 aa  1119    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  90.16 
 
 
856 aa  1518    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  71.75 
 
 
862 aa  1146    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  48.25 
 
 
871 aa  733    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  71.03 
 
 
855 aa  1148    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  70.41 
 
 
861 aa  1174    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  42.84 
 
 
886 aa  625  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  42.84 
 
 
886 aa  625  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  42.92 
 
 
883 aa  621  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  42.73 
 
 
894 aa  615  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  40.27 
 
 
902 aa  600  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  39.09 
 
 
876 aa  595  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  38.61 
 
 
894 aa  590  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  39.54 
 
 
887 aa  591  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  39.21 
 
 
906 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  41.94 
 
 
910 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  40.41 
 
 
918 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  38.88 
 
 
895 aa  576  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  40.48 
 
 
879 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  42.17 
 
 
914 aa  567  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  40.25 
 
 
877 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  40.14 
 
 
877 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  39.66 
 
 
885 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  38.59 
 
 
882 aa  559  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  42.79 
 
 
879 aa  562  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  38.08 
 
 
893 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  39.7 
 
 
901 aa  551  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  41.87 
 
 
908 aa  551  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  39.86 
 
 
881 aa  540  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  39.22 
 
 
900 aa  535  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  40.86 
 
 
939 aa  531  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  43.51 
 
 
746 aa  523  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  41.79 
 
 
751 aa  508  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  34.43 
 
 
874 aa  496  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  42.13 
 
 
722 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  34.26 
 
 
874 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  41.41 
 
 
743 aa  489  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  40.8 
 
 
730 aa  488  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  41.96 
 
 
755 aa  481  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  39.75 
 
 
727 aa  478  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  40.03 
 
 
741 aa  470  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  40.95 
 
 
744 aa  472  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  41.49 
 
 
748 aa  446  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  39.29 
 
 
723 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  38.25 
 
 
723 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  38.04 
 
 
727 aa  436  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  37.55 
 
 
730 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  28.99 
 
 
622 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  32.33 
 
 
646 aa  220  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  23.55 
 
 
741 aa  219  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  29.01 
 
 
636 aa  218  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  32.14 
 
 
637 aa  210  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  36.7 
 
 
538 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  33.33 
 
 
584 aa  206  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  35.08 
 
 
664 aa  205  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.33 
 
 
778 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.33 
 
 
778 aa  201  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  30.26 
 
 
560 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  31.51 
 
 
647 aa  191  5.999999999999999e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  30.13 
 
 
573 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.18 
 
 
757 aa  179  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  37.08 
 
 
576 aa  177  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  32.82 
 
 
328 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.99 
 
 
755 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.37 
 
 
755 aa  163  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 
1103 aa  160  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  37.87 
 
 
581 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13520  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.84 
 
 
725 aa  158  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0923131  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  37.84 
 
 
585 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  27.84 
 
 
1086 aa  157  8e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.2 
 
 
754 aa  155  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  38.05 
 
 
593 aa  153  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  36.7 
 
 
579 aa  151  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1989  Mur ligase middle domain-containing protein  31.44 
 
 
427 aa  151  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1821  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  29.1 
 
 
750 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0432982  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  36.96 
 
 
562 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  34.54 
 
 
597 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  29.92 
 
 
441 aa  147  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  35.47 
 
 
571 aa  147  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  36.49 
 
 
581 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  37.84 
 
 
585 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  36.15 
 
 
581 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  36.15 
 
 
581 aa  144  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0859  glutathione synthase  33.43 
 
 
612 aa  143  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  34.8 
 
 
578 aa  143  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>