More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1922 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1922  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 470 aa  894    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  89.57 
 
 		 480 aa  805    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0573  GntR family transcriptional regulator  98.72 
 
 		 470 aa  879    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  59.92 
 
 		 478 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1025  GntR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 499 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.684124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4302  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 521 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2235  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.32 
 
 		 473 aa  335  7e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71743 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  47.84 
 
 		 492 aa  336  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6053  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.55 
 
 		 472 aa  328  9e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1191  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.49 
 
 		 489 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419241  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0059  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.9 
 
 		 487 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.869186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 470 aa  326  6e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0047  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.71 
 
 		 482 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7471  GntR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 449 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.84 
 
 		 494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0559  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.27 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3547  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.57 
 
 		 477 aa  302  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224357  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2912  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 485 aa  300  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.784119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2637  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.21 
 
 		 493 aa  286  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4437  GntR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2642  GntR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 496 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2148  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 498 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3187  transcriptional regulator  40.04 
 
 		 487 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.685376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2755  putative transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.243959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4623  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.33 
 
 		 489 aa  276  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609617  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 490 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3935  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 503 aa  252  9.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 484 aa  240  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4822  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 496 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364543  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.19 
 
 		 488 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 504 aa  236  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.87 
 
 		 488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 490 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6846  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  39.64 
 
 		 476 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  38.09 
 
 		 496 aa  230  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 475 aa  226  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 494 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 494 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  36.85 
 
 		 494 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  36.29 
 
 		 494 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 495 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  34.81 
 
 		 508 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  36.38 
 
 		 492 aa  224  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  35.38 
 
 		 520 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 488 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 492 aa  223  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  32.78 
 
 		 498 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  38.19 
 
 		 493 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 494 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.48 
 
 		 485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 503 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.02 
 
 		 485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 509 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 509 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 490 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  38.19 
 
 		 570 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 491 aa  219  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 501 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  38.19 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 517 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  36.29 
 
 		 509 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 		 496 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 504 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 488 aa  217  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4617  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 480 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  34.5 
 
 		 509 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 504 aa  217  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 493 aa  217  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.66 
 
 		 471 aa  216  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.43 
 
 		 499 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 574 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  34.25 
 
 		 475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000463  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 501 aa  213  5.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05334  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 470 aa  213  7.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 496 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 501 aa  212  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  33.97 
 
 		 489 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.83 
 
 		 490 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.05 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.92 
 
 		 495 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 547 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000554  transcriptional regulator GntR family/aminotransferase class-i  32.51 
 
 		 481 aa  209  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 505 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  31.56 
 
 		 499 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 502 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 502 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.87 
 
 		 501 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 502 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 477 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.54 
 
 		 499 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 477 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1766  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 495 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0178968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.61 
 
 		 496 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6494  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 482 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>