151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0002 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0002  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 
131 aa  265  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0049965  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3107  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  41.88 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.46 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3156  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.46 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116532  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2525  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.62 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.16284e-21  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4229  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.85 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.289876  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1986  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.91 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000114439  normal  0.0153833 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3349  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.75 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2961  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.04 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0570093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1517  HNS family histone-like protein  35.04 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0169  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.04 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4056  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.43 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4385  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.78 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0118502  normal  0.891502 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1651  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.92 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0526  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.13 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0441  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.14 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.940607  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2782  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.94 
 
 
102 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0983316  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3068  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.08 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.280777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03185  DNA-binding protein  31.82 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1793  DNA-binding protein  28 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4162  hypothetical protein  30.77 
 
 
247 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1489  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  53.49 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7372  H-NS family DNA-binding protein  31.9 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2714  DNA-binding protein BprA  37.84 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344106  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4136  hypothetical protein  31.62 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1726  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0439  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.77 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000352276  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.64 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.64 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6777  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.68 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.06 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00711  putative HNS-like transcription regulator protein  31.19 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000172984  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4798  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.28 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3721  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.28 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00112888  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.23 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.19 
 
 
99 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0838  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.05 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3387  DNA-binding protein H-NS-like protein  29.75 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4886  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.4 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.602991  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3069  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  29.17 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.39515  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3562  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.07 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.626821  normal  0.684238 
 
 
-
 
NC_003296  RS02004  putative HNS-like transcription regulator protein  30.28 
 
 
95 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0969964  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1863  regulator protein, putative  29.91 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000371113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2905  H-NS histone family protein  33.64 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0048  H-NS histone family protein  33.64 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3155  H-NS histone family protein  33.64 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1957  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  51.28 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00140882  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3404  H-NS histone family protein  33.64 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237819  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1636  H-NS histone family protein  33.64 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3827  H-NS histone family protein  33.64 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3909  H-NS histone family protein  33.64 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2965  H-NS histone family protein  33.64 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.58 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.811955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3384  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.03 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0843  DNA-binding protein BprA  34.09 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0798  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  27.34 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835916  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2575  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.6 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1152  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.6 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3493  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.17 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.572012  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4714  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.11 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.991534  normal  0.729946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0190  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.94 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317548  hitchhiker  0.0000000190695 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0263  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.03 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  34.04 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2825  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.03 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0281  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.03 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166699  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0019  H-NS histone family  29.55 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0209  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.03 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.726678 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0195  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.03 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750004  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1136  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00265311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.79 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634664  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.04 
 
 
102 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0867  putative HNS-like transcription regulator protein  31.25 
 
 
96 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2738  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  47.5 
 
 
139 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1968  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.91 
 
 
93 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.51 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5922  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.14 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.997127  normal  0.678214 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  28.69 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4700  DNA-binding protein  29.2 
 
 
144 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01827  hypothetical protein  32.08 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.51 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4321  putative HNS-like transcriptional regulator  32.43 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2135  putative DNA-binding protein  30.85 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45202  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2329  H-NS histone family protein  30.3 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1305  hitchhiker  0.00000000912792 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4689  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.36 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6191  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.53 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4786  H-NS histone family protein  28.33 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.428354 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0208  H-NS histone family protein  33.67 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00707733  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0398  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3154  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  38.16 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5655  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.31 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5214  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.16 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3053  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.84 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0965485  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.16 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1616  H-NS histone family protein  33.67 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0126  H-NS histone family protein  33.67 
 
 
101 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0099  H-NS histone family protein  33.67 
 
 
101 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5155  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.7 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336859  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.53 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222409  normal  0.184824 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.14 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6084  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.74 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78955  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>