76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1651 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1651  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 		 107 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0526  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.4 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03185  DNA-binding protein  39.02 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0439  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.95 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000352276  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.46 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4229  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  40.54 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.289876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0002  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.75 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0049965  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4056  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  42.86 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3349  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.18 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1024  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.62 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0737742  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1726  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.96 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1793  DNA-binding protein  34.96 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3156  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.29 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116532  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4385  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.1 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0118502  normal  0.891502 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2961  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.45 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0570093 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1489  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.56 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1957  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  28.85 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00140882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2782  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.69 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0983316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0169  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.64 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1517  HNS family histone-like protein  33.64 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4136  hypothetical protein  32.69 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4162  hypothetical protein  33.98 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1986  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  26.67 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000114439  normal  0.0153833 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0798  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.73 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3107  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.34 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2525  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  28.57 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.16284e-21  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7372  H-NS family DNA-binding protein  34.62 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3069  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  60 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.39515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2714  DNA-binding protein BprA  29 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344106  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3068  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  57.5 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.280777  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1863  regulator protein, putative  35.58 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000371113  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2738  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  46.94 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3562  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.62 
 
 		 139 aa  48.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.626821  normal  0.684238 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  38.16 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2688  hypothetical protein  52.94 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.299941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3493  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  46.51 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.572012  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2911  hypothetical protein  52.94 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  38.16 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3165  putative HNS-like transcription regulator protein  32.08 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480481 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0441  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.88 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.940607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2135  putative DNA-binding protein  34.62 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45202  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4633  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.51 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.000000000000292632  decreased coverage  0.0000243295 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5655  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.53 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1598  nucleoid protein H-NS  47.37 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2585  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.94 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000212728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6696  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.9 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.685774  normal  0.68943 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2742  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  32.04 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0019  H-NS histone family  30.95 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02004  putative HNS-like transcription regulator protein  30.77 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0969964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.89 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0766  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.19 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6382  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.77 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193522  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4689  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.57 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4886  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.82 
 
 		 114 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.602991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7403  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.55 
 
 		 96 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6777  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.12 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6084  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.47 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.55 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.55 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4128  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.05 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382519  hitchhiker  0.00000000510411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1913  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.05 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000183319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1710  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.34 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.443687  normal  0.618525 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3806  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.26 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0101066  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6191  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.91 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.99 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222409  normal  0.184824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.24 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0398  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  52.5 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1225  H-NS histone family protein  34.18 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000571024  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0068  H-NS histone family protein  34.18 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000181219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4071  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.34 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737815 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0098  H-NS histone family protein  34.18 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000405362  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1506  H-NS histone family protein  34.18 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000220305  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0079  H-NS histone family protein  34.18 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.0000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4321  putative HNS-like transcriptional regulator  52.5 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  41.51 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>