92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1957 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1957  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 		 121 aa  248  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00140882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.16 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0439  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.57 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000352276  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4229  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  35 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.289876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03185  DNA-binding protein  37.4 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4056  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0798  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.89 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1024  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.84 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0737742  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4385  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.58 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0118502  normal  0.891502 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3156  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.78 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116532  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3349  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.81 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4162  hypothetical protein  31.48 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2961  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.31 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0570093 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0169  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.31 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1517  HNS family histone-like protein  34.31 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1793  DNA-binding protein  32.74 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4136  hypothetical protein  35.58 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1726  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.74 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7372  H-NS family DNA-binding protein  34 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2738  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.78 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0526  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.48 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2525  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.43 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.16284e-21  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3068  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  28.04 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.280777  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3107  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.62 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3069  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.11 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.39515  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  45.83 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  46.81 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1651  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.41 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  46.94 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  31.63 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2945  DNA binding protein, nucleoid-associated  42.11 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.14201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2997  DNA binding protein, nucleoid-associated  42.11 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.0364479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2980  DNA binding protein, nucleoid-associated  42.11 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.681217  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2913  DNA binding protein, nucleoid-associated  42.11 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3102  DNA binding protein, nucleoid-associated  42.11 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal  0.844597 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1986  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  25.96 
 
 		 105 aa  50.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000114439  normal  0.0153833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.68 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3149  DNA binding protein, nucleoid-associated  45.61 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000112797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2782  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.66 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0983316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0002  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  51.28 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0049965  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3562  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.7 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.626821  normal  0.684238 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1863  regulator protein, putative  28.04 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000371113  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2329  H-NS histone family protein  50 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1305  hitchhiker  0.00000000912792 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0490  hypothetical protein  32.11 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5155  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.28 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336859  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01827  hypothetical protein  51.35 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0019  H-NS histone family  39.22 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  54.76 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00994  DNA-binding protein, H-NS family  40.28 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0700  DNA-binding protein VicH  40.43 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1152  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.24 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003852  DNA-binding protein H-NS  37.84 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0195644  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0441  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.940607  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2585  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.2 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000212728  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1014  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.06 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4786  H-NS histone family protein  28.71 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.428354 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2575  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02489  hypothetical protein  47.06 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.5 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3911  DNA binding protein, nucleoid-associated  47.06 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.268261 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02525  DNA binding protein, nucleoid-associated  47.06 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2949  DNA binding protein, nucleoid-associated  47.06 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2789  DNA binding protein, nucleoid-associated  47.06 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1037  DNA binding protein, nucleoid-associated  47.06 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3212  DNA binding protein, nucleoid-associated  47.06 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.28 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386763  normal  0.64236 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1754  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.62 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2804  DNA binding protein, nucleoid-associated  45.1 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2742  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.37 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2688  hypothetical protein  36.92 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.299941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3984  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  46.15 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49889  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.19 
 
 		 99 aa  42  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3493  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.65 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.572012  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5080  Ler  45 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0343561 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2145  DNA binding protein, global metabolism regulator  47.62 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.110406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2856  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.36 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3165  putative HNS-like transcription regulator protein  43.24 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480481 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6773  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.48 
 
 		 112 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00017117  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2605  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.62 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.730726  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4886  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  46.15 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.602991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2207  H-NS histone family protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000144624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3053  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.95 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0965485  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1551  H-NS histone family protein  33.33 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000358636  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0401  H-NS histone family protein  33.33 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000304691  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1739  H-NS histone family protein  33.33 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1239  H-NS histone family protein  33.33 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000958752  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3002  H-NS histone family protein  33.33 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2886  H-NS histone family protein  33.33 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000145694  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0365  H-NS histone family protein  33.33 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000040716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>