78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0526 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0526  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 		 127 aa  249  6e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03185  DNA-binding protein  67.46 
 
 		 153 aa  156  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1726  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  59.52 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1793  DNA-binding protein  59.52 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3562  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.35 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.626821  normal  0.684238 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0439  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.09 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000352276  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0002  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  43.68 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0049965  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.59 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1024  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.21 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0737742  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1651  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.4 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1863  regulator protein, putative  34.65 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000371113  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1957  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  35.48 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00140882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3107  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.91 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4162  hypothetical protein  34.68 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2525  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  38.14 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.16284e-21  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3068  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  55.32 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.280777  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2782  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.17 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0983316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3069  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.62 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.39515  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1986  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.88 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000114439  normal  0.0153833 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4056  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.06 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.25 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.25 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.76 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4136  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4385  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.61 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0118502  normal  0.891502 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.83 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.45 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.811955 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2961  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.41 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0570093 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0169  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.48 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3349  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.96 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1517  HNS family histone-like protein  31.48 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4229  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  36.07 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.289876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3156  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.02 
 
 		 105 aa  50.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116532  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  41.18 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7372  H-NS family DNA-binding protein  33.33 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0798  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.65 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1489  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.73 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4886  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  55.1 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.602991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3493  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.572012  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3984  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  38.78 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49889  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0838  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  63.16 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2738  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  49.02 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2135  putative DNA-binding protein  38.89 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45202  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4220  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.86 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0019  H-NS histone family  28.57 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0441  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.35 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.940607  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4578  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.78 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.79 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.79 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.59 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.26 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222409  normal  0.184824 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6696  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.84 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.685774  normal  0.68943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4935  putative H-NS histon-like DNA-binding protein  33.68 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.529231  normal  0.833407 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5655  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.89 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  51.16 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4070  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.53 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000676326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3595  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.93 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3149  DNA binding protein, nucleoid-associated  37.93 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000112797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4321  putative HNS-like transcriptional regulator  53.49 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0398  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  53.49 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.62 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.83 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167387  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  51.92 
 
 		 102 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3525  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  52.38 
 
 		 123 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.698098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5080  Ler  39.29 
 
 		 123 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0343561 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6084  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.17 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3806  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.97 
 
 		 100 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0101066  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4282  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.72 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0105949  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6191  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.91 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  48.84 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1341  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.03 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000011697  hitchhiker  0.000659538 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  36.73 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.27 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5922  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.98 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.997127  normal  0.678214 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6382  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.11 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193522  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4633  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.36 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.000000000000292632  decreased coverage  0.0000243295 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3224  DNA-binding protein BprA  45.95 
 
 		 101 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0088  DNA-binding protein BprA  45.95 
 
 		 101 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>