234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5922 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5922  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 		 102 aa  202  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.997127  normal  0.678214 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6191  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  98.04 
 
 		 102 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7383  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  86.27 
 
 		 102 aa  170  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4282  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  65 
 
 		 100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0105949  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1570  H-NS histone family protein  61.17 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000103893  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0068  H-NS histone family protein  61.17 
 
 		 99 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000181219  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1225  H-NS histone family protein  61.17 
 
 		 99 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000571024  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0079  H-NS histone family protein  61.17 
 
 		 108 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.0000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1506  H-NS histone family protein  61.17 
 
 		 108 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000220305  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0098  H-NS histone family protein  61.17 
 
 		 108 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000405362  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6929  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  58 
 
 		 99 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.599841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0265  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  53.92 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6084  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  56.44 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6382  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  54 
 
 		 99 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193522  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4633  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  64.65 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.000000000000292632  decreased coverage  0.0000243295 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5767  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  55.88 
 
 		 99 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3806  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  56.57 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0101066  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  52.53 
 
 		 100 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49 
 
 		 100 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3154  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  52.53 
 
 		 100 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5214  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  52.53 
 
 		 100 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6596  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  54 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6922  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  58.16 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6696  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  58 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.685774  normal  0.68943 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1558  H-NS histone family protein  51.49 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.752713  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  49.5 
 
 		 100 aa  94.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0843  DNA-binding protein BprA  56.57 
 
 		 96 aa  94.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.51 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2135  putative DNA-binding protein  61.25 
 
 		 79 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45202  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5655  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  56 
 
 		 128 aa  93.6  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.49 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  49.49 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0398  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4321  putative HNS-like transcriptional regulator  45 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  46.53 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.811955 
 
 
-
 
NC_003296  RS00711  putative HNS-like transcription regulator protein  51.96 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000172984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  46.46 
 
 		 97 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2867  H-NS histone family protein  49.5 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0084  H-NS histone family protein  49.5 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3862  H-NS histone family protein  49.5 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6525  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  57 
 
 		 99 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381726 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3721  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.02 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00112888  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4798  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.02 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3109  H-NS histone family protein  49.5 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5671  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  57 
 
 		 99 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3943  H-NS histone family protein  49.5 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6035  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  57 
 
 		 99 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.401704 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3442  H-NS histone family protein  49.5 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1677  H-NS histone family protein  49.5 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0209  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.88 
 
 		 97 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.726678 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2072  H-NS histone family protein  50.48 
 
 		 96 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0195  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.88 
 
 		 97 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750004  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2905  H-NS histone family protein  43.3 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1636  H-NS histone family protein  43.3 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741416  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3155  H-NS histone family protein  43.3 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3909  H-NS histone family protein  43.3 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2965  H-NS histone family protein  43.3 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3404  H-NS histone family protein  43.3 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3827  H-NS histone family protein  43.3 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0048  H-NS histone family protein  43.3 
 
 		 125 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0755  H-NS histone family protein  52.53 
 
 		 100 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0220992  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0569  HNS-like transcription regulator protein  52.53 
 
 		 100 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147609  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2075  DNA-binding protein BprA  52.53 
 
 		 100 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585602  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1529  DNA-binding protein BprA  52.53 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2160  DNA-binding protein BprA  52.53 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0263  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.88 
 
 		 97 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2825  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  43.88 
 
 		 97 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0281  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.88 
 
 		 97 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1706  H-NS histone family protein  48.48 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1174  H-NS histone family protein  48.48 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0720  H-NS histone family protein  48.48 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232457  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0742  H-NS histone family protein  48.48 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2442  H-NS histone family protein  48.48 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1247  H-NS histone family protein  48.48 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02004  putative HNS-like transcription regulator protein  52.58 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0969964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3384  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  42.86 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.75 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0190  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.86 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317548  hitchhiker  0.0000000190695 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7449  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  54 
 
 		 99 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5567  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  57 
 
 		 99 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000568054  normal  0.0551965 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6005  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  44.55 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.36 
 
 		 98 aa  83.6  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.36 
 
 		 98 aa  83.6  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4990  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  46.15 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0212879  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.98 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3351  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  44.44 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.383074 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3595  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.61 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4070  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.61 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000676326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0099  H-NS histone family protein  42.57 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3189  H-NS histone family protein  46.39 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2981  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.51 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207499  decreased coverage  0.0000000417224 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0208  H-NS histone family protein  41.58 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00707733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1616  H-NS histone family protein  41.58 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0126  H-NS histone family protein  41.58 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0231  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.92 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2858  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  45.92 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.259744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0249  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.92 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0175  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.92 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0162  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.92 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121985  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4935  putative H-NS histon-like DNA-binding protein  43.27 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.529231  normal  0.833407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>