84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1986 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1986  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 		 105 aa  213  5e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000114439  normal  0.0153833 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0441  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  46 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.940607  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1489  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.57 
 
 		 115 aa  88.6  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2525  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  40.19 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.16284e-21  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4229  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  41.9 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.289876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4056  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0798  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4385  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.42 
 
 		 105 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0118502  normal  0.891502 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4162  hypothetical protein  36.54 
 
 		 247 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3107  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.69 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0002  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  29.91 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0049965  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1863  regulator protein, putative  32.71 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000371113  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.65 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1517  HNS family histone-like protein  34.62 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0169  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.62 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2961  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.62 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0570093 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2782  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.62 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0983316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1024  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.38 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0737742  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0439  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.88 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000352276  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3156  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.54 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116532  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3349  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.54 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7372  H-NS family DNA-binding protein  33.65 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4136  hypothetical protein  31.73 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0526  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.88 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3562  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.48 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.626821  normal  0.684238 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1957  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  25.96 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00140882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1651  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  26.67 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03185  DNA-binding protein  27.56 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3069  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  29.36 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.39515  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3068  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  47.22 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.280777  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.18 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2965  H-NS histone family protein  34.88 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2905  H-NS histone family protein  34.88 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3909  H-NS histone family protein  34.88 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3827  H-NS histone family protein  34.88 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3717  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.76 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.989758  hitchhiker  0.00118334 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1636  H-NS histone family protein  34.88 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0048  H-NS histone family protein  34.88 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3404  H-NS histone family protein  34.88 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237819  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3155  H-NS histone family protein  34.88 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.45 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0519  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  24.24 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000291454  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1793  DNA-binding protein  36.73 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1726  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.69 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0490  hypothetical protein  26.53 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3384  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2714  DNA-binding protein BprA  35.82 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344106  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0281  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166699  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0195  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750004  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2825  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  33.33 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0209  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.726678 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1136  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.13 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00265311  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.36 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0263  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  26.04 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6619  putative HNS-like protein  36.56 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.890454 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4070  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.27 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000676326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.4 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0190  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317548  hitchhiker  0.0000000190695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.41 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.811955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4465  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.73 
 
 		 92 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.695514  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1781  hypothetical protein  52.94 
 
 		 63 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6777  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.38 
 
 		 99 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 100 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0019  H-NS histone family  28.28 
 
 		 141 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0398  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3595  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.27 
 
 		 95 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4321  putative HNS-like transcriptional regulator  33.33 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4700  DNA-binding protein  26.26 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3387  DNA-binding protein H-NS-like protein  26.26 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7403  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.34 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  26.56 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2220  H-NS histone family protein  28.75 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.999721  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.56 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6044  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.52 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.304642 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0098  H-NS histone family protein  29.35 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000405362  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3721  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.34 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00112888  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1506  H-NS histone family protein  29.35 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000220305  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1913  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.95 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000183319 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0079  H-NS histone family protein  29.35 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.0000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4798  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.34 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4128  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.95 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382519  hitchhiker  0.00000000510411 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5655  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.68 
 
 		 128 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>