96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3069 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3069  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 		 130 aa  268  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.39515  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3068  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  55.37 
 
 		 122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.280777  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2738  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  45.87 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03185  DNA-binding protein  33.88 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1863  regulator protein, putative  36.84 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000371113  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4056  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.03 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4162  hypothetical protein  33.94 
 
 		 247 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3156  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.63 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116532  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.04 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4385  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.19 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0118502  normal  0.891502 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3349  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.97 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2961  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.86 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0570093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0798  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  26.72 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4229  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.86 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.289876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0169  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.94 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0439  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.62 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000352276  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1517  HNS family histone-like protein  33.94 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2782  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.22 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0983316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1489  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.02 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1957  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.11 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00140882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3107  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.11 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1024  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0737742  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0526  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.02 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.74 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1793  DNA-binding protein  42.55 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1136  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.58 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00265311  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0002  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  29.17 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0049965  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1726  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.43 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1651  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  60 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7372  H-NS family DNA-binding protein  28.89 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.79 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0441  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.96 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.940607  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.19 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.79 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1986  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.36 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000114439  normal  0.0153833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  30.3 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4578  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.94 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2329  H-NS histone family protein  30.89 
 
 		 134 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1305  hitchhiker  0.00000000912792 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3562  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  46.34 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.626821  normal  0.684238 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6696  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.85 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.685774  normal  0.68943 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3493  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.62 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.572012  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.22 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.811955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  42.11 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.61 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3984  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  55 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49889  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4136  hypothetical protein  45.95 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  32 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2585  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.43 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000212728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2856  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.32 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01827  hypothetical protein  27.59 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1616  H-NS histone family protein  28.72 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0208  H-NS histone family protein  28.72 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00707733  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3279  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.04 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0515948 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0099  H-NS histone family protein  28.72 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1152  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.17 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5655  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  67.86 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7403  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.89 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3224  DNA-binding protein BprA  28.72 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0088  DNA-binding protein BprA  28.72 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0126  H-NS histone family protein  29.07 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2575  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.17 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3053  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.43 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0965485  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2010  H-NS histone family protein  44.26 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0227527  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2605  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.92 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.730726  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6084  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.11 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4462  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  39.22 
 
 		 99 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168905  normal  0.0423453 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6182  hypothetical protein  31.86 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633203  normal  0.361807 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3959  hypothetical protein  27.78 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0572114  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6382  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 		 99 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193522  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0838  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.71 
 
 		 94 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4886  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.75 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.602991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2207  H-NS histone family protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000144624  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0365  H-NS histone family protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000040716  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2886  H-NS histone family protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000145694  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1981  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  28.57 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.295466  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0401  H-NS histone family protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000304691  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3002  H-NS histone family protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1239  H-NS histone family protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000958752  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1739  H-NS histone family protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1551  H-NS histone family protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000358636  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  28.43 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.95 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  36.47 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0019  H-NS histone family  35 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3525  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  43.14 
 
 		 123 aa  40.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.698098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1444  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  25.23 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.292783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.47 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0398  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.96 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2688  hypothetical protein  44.12 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.299941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.08 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  29.55 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0265  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.04 
 
 		 98 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>