48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7372 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_7372  H-NS family DNA-binding protein  100 
 
 		 104 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4162  hypothetical protein  51.4 
 
 		 247 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4385  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50.48 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0118502  normal  0.891502 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4056  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  49.52 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2961  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49 
 
 		 104 aa  90.5  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0570093 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0169  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4136  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1517  HNS family histone-like protein  47 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4229  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  39.42 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.289876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.9 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1024  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.25 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0737742  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2782  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0983316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0798  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.65 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3156  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.99 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116532  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3349  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.06 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1957  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00140882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1986  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.65 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000114439  normal  0.0153833 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3107  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.31 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0002  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.9 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0049965  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1793  DNA-binding protein  36.17 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1726  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.52 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2525  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.01 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.16284e-21  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0439  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.09 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000352276  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2688  hypothetical protein  34 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.299941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1651  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  54.29 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1489  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.73 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0416  nucleoid protein H-NS  31.73 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0193878  hitchhiker  0.00866736 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2911  hypothetical protein  36.46 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3069  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  28.89 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.39515  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1863  regulator protein, putative  31.25 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000371113  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  38.36 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.95 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0526  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.61 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3068  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  25.89 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.280777  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2220  H-NS histone family protein  26.8 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.999721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03185  DNA-binding protein  33.61 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  39.73 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0441  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.91 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.940607  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2585  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  26.05 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000212728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3165  putative HNS-like transcription regulator protein  41.46 
 
 		 118 aa  42.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.89 
 
 		 98 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.89 
 
 		 98 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3493  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  26.92 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.572012  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1598  nucleoid protein H-NS  45.95 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2742  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.11 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4465  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.695514  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4587  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35 
 
 		 112 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.91 
 
 		 99 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>