67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4587 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4587  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 		 112 aa  227  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6773  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  78.57 
 
 		 112 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00017117  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2172  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  61.68 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970391 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4222  hypothetical protein  65.05 
 
 		 108 aa  140  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5701  hypothetical protein  64.08 
 
 		 108 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1018  hypothetical protein  62.86 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697598  normal  0.0957494 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6195  hypothetical protein  86.57 
 
 		 84 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170725  normal  0.0606924 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2592  hypothetical protein  56.84 
 
 		 97 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2777  hypothetical protein  47.3 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000199644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3930  hypothetical protein  39.19 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1142  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.74 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6763  hypothetical protein  47.3 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0430903  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3892  hypothetical protein  40.79 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5064  hypothetical protein  40.26 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02370  hypothetical protein  36.11 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14298  normal  0.0406002 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6348  hypothetical protein  37.18 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00180642  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4294  hypothetical protein  35.37 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4404  hypothetical protein  35.37 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  34.62 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.62 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 102 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3959  hypothetical protein  31.25 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0572114  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 102 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.76 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1172  putative DNA-binding protein H-NS  32.53 
 
 		 122 aa  50.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4462  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  40.62 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168905  normal  0.0423453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  30.67 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  35.37 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6383  hypothetical protein  32.14 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1444  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.47 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.292783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3237  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.05 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.602482 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0798  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  29.49 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  26.32 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4578  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  25.26 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1136  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.73 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00265311  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1351  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.87 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0110439  hitchhiker  0.00767889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1416  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00233677  normal  0.422691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1404  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.87 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773951  normal  0.9865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3146  H-NS family DNA-binding protein  29.87 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3068  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.1 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.280777  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2996  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.87 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.18601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4220  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.29 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1168  H-NS family DNA-binding protein  33.77 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.827071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2848  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.87 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000899352  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1510  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.87 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000161891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2867  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.87 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00308675  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2512  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.87 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00123836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5080  Ler  28.4 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0343561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.65 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4229  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  27.63 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.289876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2329  H-NS histone family protein  28.24 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1305  hitchhiker  0.00000000912792 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00994  DNA-binding protein, H-NS family  29.73 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  30.38 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2961  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.77 
 
 		 104 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0570093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2585  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.57 
 
 		 130 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000212728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.87 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112117  normal  0.570223 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.22 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2742  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.71 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4385  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.17 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0118502  normal  0.891502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1517  HNS family histone-like protein  31.17 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0169  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.17 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3984  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  41.67 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49889  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01827  hypothetical protein  27.71 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0519  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.78 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000291454  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7372  H-NS family DNA-binding protein  35 
 
 		 104 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>