38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3892 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3892  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2777  hypothetical protein  65.52 
 
 
87 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000199644  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6763  hypothetical protein  64.37 
 
 
87 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0430903  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3930  hypothetical protein  57.89 
 
 
85 aa  91.3  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02370  hypothetical protein  54.79 
 
 
83 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14298  normal  0.0406002 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1018  hypothetical protein  48.68 
 
 
110 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697598  normal  0.0957494 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5701  hypothetical protein  48.68 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2592  hypothetical protein  47.69 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658103  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4222  hypothetical protein  44.74 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804885  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4294  hypothetical protein  44.3 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4404  hypothetical protein  44.3 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5064  hypothetical protein  43.84 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4587  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.79 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6348  hypothetical protein  43.42 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00180642  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4462  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  36.96 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168905  normal  0.0423453 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1142  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.21 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6773  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.79 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00017117  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2172  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.56 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000970391 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6383  hypothetical protein  40.24 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621443  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3959  hypothetical protein  34.31 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0572114  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1172  putative DNA-binding protein H-NS  40.24 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  37.5 
 
 
102 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6195  hypothetical protein  39.39 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170725  normal  0.0606924 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.62 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.56 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.62 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  32.88 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.31 
 
 
72 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386763  normal  0.64236 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5155  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.31 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336859  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4578  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.7 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5655  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.62 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.63 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2742  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.43 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.17 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1570  H-NS histone family protein  33.33 
 
 
173 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000103893  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1225  H-NS histone family protein  33.33 
 
 
99 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000571024  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0068  H-NS histone family protein  33.33 
 
 
99 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000181219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>