40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2172 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2172  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 		 108 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970391 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4222  hypothetical protein  65.71 
 
 		 108 aa  144  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6773  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  63.81 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00017117  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4587  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  61.68 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5701  hypothetical protein  61.17 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1018  hypothetical protein  60 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697598  normal  0.0957494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2592  hypothetical protein  51.58 
 
 		 97 aa  97.1  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6195  hypothetical protein  64.18 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170725  normal  0.0606924 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1142  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2777  hypothetical protein  44.59 
 
 		 87 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000199644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3930  hypothetical protein  37.84 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6763  hypothetical protein  43.24 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0430903  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3892  hypothetical protein  41.56 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02370  hypothetical protein  35.62 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14298  normal  0.0406002 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5064  hypothetical protein  40.26 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  37.18 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  37.18 
 
 		 102 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4294  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  50.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4404  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  50.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1172  putative DNA-binding protein H-NS  53.85 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.43 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.43 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  32.43 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.57 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6348  hypothetical protein  35.06 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00180642  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6383  hypothetical protein  51.35 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621443  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3959  hypothetical protein  41.18 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0572114  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.94 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4220  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.69 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4462  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  48.65 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168905  normal  0.0423453 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1136  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.94 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00265311  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4578  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.37 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3984  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  25 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49889  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  26.32 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  31.58 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.23 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386763  normal  0.64236 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5080  Ler  25.32 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0343561 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4056  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  25.64 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.26 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  30.95 
 
 		 115 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>