53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5064 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_5064  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  197  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1142  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  67.86 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6348  hypothetical protein  61.54 
 
 		 83 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00180642  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6383  hypothetical protein  54.12 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621443  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02370  hypothetical protein  57.53 
 
 		 83 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14298  normal  0.0406002 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1172  putative DNA-binding protein H-NS  54.22 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4462  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  45.1 
 
 		 99 aa  83.6  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168905  normal  0.0423453 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3959  hypothetical protein  43.88 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0572114  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4404  hypothetical protein  51.25 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4294  hypothetical protein  51.25 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2777  hypothetical protein  43.84 
 
 		 87 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000199644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3892  hypothetical protein  43.84 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1018  hypothetical protein  38.67 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697598  normal  0.0957494 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5701  hypothetical protein  38.67 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  40.66 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3930  hypothetical protein  38.67 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4222  hypothetical protein  40.54 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6763  hypothetical protein  42.47 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0430903  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4587  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.26 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  38.46 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2172  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.26 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970391 
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  36.26 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6773  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00017117  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.27 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.9 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.9 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2592  hypothetical protein  33.8 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5155  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.67 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336859  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.14 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386763  normal  0.64236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1136  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.93 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00265311  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1064  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  24.74 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.23 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7403  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.82 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.49 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4578  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.35 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.62 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6044  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.27 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.304642 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.59 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6195  hypothetical protein  34.33 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170725  normal  0.0606924 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5080  Ler  33.33 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0343561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.85 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3068  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.9 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.280777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.97 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.811955 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.33 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1416  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.17 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00233677  normal  0.422691 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4385  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.65 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0118502  normal  0.891502 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.25 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.25 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0798  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  23.26 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4229  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  26.51 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.289876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003852  DNA-binding protein H-NS  35.09 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0195644  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3279  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0515948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3237  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.38 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.602482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>