41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6763 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6763  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  178  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0430903  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2777  hypothetical protein  87.36 
 
 		 87 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000199644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3892  hypothetical protein  64.37 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3930  hypothetical protein  55.26 
 
 		 85 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1018  hypothetical protein  47.3 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697598  normal  0.0957494 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5701  hypothetical protein  47.3 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4587  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.3 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6773  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.95 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00017117  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4222  hypothetical protein  43.24 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2172  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.24 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4462  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  43.01 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168905  normal  0.0423453 
 
 
-
 
NC_003296  RS02370  hypothetical protein  45.83 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14298  normal  0.0406002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2592  hypothetical protein  45.45 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5064  hypothetical protein  41.1 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1142  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.47 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  42.31 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6348  hypothetical protein  40.85 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00180642  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3959  hypothetical protein  34.31 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0572114  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1172  putative DNA-binding protein H-NS  38.96 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6383  hypothetical protein  38.96 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621443  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4294  hypothetical protein  39.24 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4404  hypothetical protein  39.24 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  38.46 
 
 		 102 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.29 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.29 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  31.76 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6195  hypothetical protein  46.27 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170725  normal  0.0606924 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.1 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386763  normal  0.64236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  37.5 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5655  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.06 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5155  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.48 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336859  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.95 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6084  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.47 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6382  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.1 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193522  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0416  nucleoid protein H-NS  47.06 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0193878  hitchhiker  0.00866736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2742  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.72 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5080  Ler  27.4 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0343561 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1064  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  27.03 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.55 
 
 		 103 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  33.33 
 
 		 100 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>