97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1598 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1598  nucleoid protein H-NS  100 
 
 		 117 aa  232  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3165  putative HNS-like transcription regulator protein  48.18 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480481 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2742  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.02 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0416  nucleoid protein H-NS  38.18 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0193878  hitchhiker  0.00866736 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  42.45 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  39.62 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.78 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.78 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  33.93 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5080  Ler  35.59 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0343561 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4886  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.7 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.602991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.8 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1136  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.51 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00265311  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.74 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5155  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.67 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336859  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.62 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.78 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  33.7 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  36.63 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4578  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.65 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3493  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.11 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.572012  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1677  H-NS histone family protein  35.16 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3862  H-NS histone family protein  35.16 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3943  H-NS histone family protein  35.16 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3109  H-NS histone family protein  35.16 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3442  H-NS histone family protein  35.16 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0084  H-NS histone family protein  35.16 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2867  H-NS histone family protein  35.16 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4056  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  43.75 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3525  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.36 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.698098  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6772  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.9 
 
 		 254 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000000111168  normal  0.0541472 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0231  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.78 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0249  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.78 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2858  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.78 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.259744  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3351  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.7 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.383074 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3189  H-NS histone family protein  35.16 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4385  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.25 
 
 		 105 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0118502  normal  0.891502 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0175  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.78 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0162  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.78 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3827  H-NS histone family protein  35.11 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2905  H-NS histone family protein  35.11 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0048  H-NS histone family protein  35.11 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2965  H-NS histone family protein  35.11 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3155  H-NS histone family protein  35.11 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3909  H-NS histone family protein  35.11 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1064  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  35.48 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1636  H-NS histone family protein  35.11 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741416  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.04 
 
 		 97 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3404  H-NS histone family protein  35.11 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237819  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6743  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.77 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4220  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.1 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3384  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.17 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.97 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2825  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0281  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166699  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0263  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0190  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317548  hitchhiker  0.0000000190695 
 
 
-
 
NC_003296  RS00711  putative HNS-like transcription regulator protein  34.04 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000172984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3984  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.63 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49889  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6182  hypothetical protein  30.25 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633203  normal  0.361807 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0209  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.38 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.726678 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0195  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.38 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750004  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5701  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.67 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4162  hypothetical protein  51.16 
 
 		 247 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.08 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386763  normal  0.64236 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3721  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.98 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00112888  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6005  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.63 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4798  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.98 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2981  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.07 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207499  decreased coverage  0.0000000417224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.03 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1651  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.37 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3707  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.9 
 
 		 217 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258134  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  30.43 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6900  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.71 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7403  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.17 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1968  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.97 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02004  putative HNS-like transcription regulator protein  32.29 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0969964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.07 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4990  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.53 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0212879  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0867  putative HNS-like transcription regulator protein  28.72 
 
 		 96 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4321  putative HNS-like transcriptional regulator  30.85 
 
 		 100 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4935  putative H-NS histon-like DNA-binding protein  31.25 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.529231  normal  0.833407 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6382  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.98 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193522  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0398  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.79 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7372  H-NS family DNA-binding protein  45.95 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0490  hypothetical protein  26.67 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6929  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.87 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.599841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4689  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1793  DNA-binding protein  36.11 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1142  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.72 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2010  H-NS histone family protein  30.53 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0227527  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  52.38 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6084  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.91 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6044  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  26.47 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.304642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4071  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.58 
 
 		 95 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737815 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>