233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0867 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0867  putative HNS-like transcription regulator protein  100 
 
 		 96 aa  191  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_003296  RS02004  putative HNS-like transcription regulator protein  82.29 
 
 		 95 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0969964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00711  putative HNS-like transcription regulator protein  72.92 
 
 		 96 aa  143  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000172984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4798  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  75.26 
 
 		 96 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3721  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  75.26 
 
 		 96 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00112888  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4689  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  61.54 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  63.16 
 
 		 97 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521264  normal  0.418842 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  54.17 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  53.12 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6005  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  51.49 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  54.55 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  52.58 
 
 		 97 aa  100  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  54.55 
 
 		 100 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2905  H-NS histone family protein  48.45 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0048  H-NS histone family protein  48.45 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3827  H-NS histone family protein  48.45 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1636  H-NS histone family protein  48.45 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741416  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3909  H-NS histone family protein  48.45 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3155  H-NS histone family protein  48.45 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3404  H-NS histone family protein  48.45 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237819  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2965  H-NS histone family protein  48.45 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0263  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.45 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2825  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  48.45 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0281  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.45 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166699  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0209  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.45 
 
 		 97 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.726678 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3384  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  47.42 
 
 		 97 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1558  H-NS histone family protein  51.04 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.752713  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0195  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.45 
 
 		 97 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750004  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5562  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  50.98 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0190  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.42 
 
 		 97 aa  96.7  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317548  hitchhiker  0.0000000190695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4990  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  50 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0212879  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3279  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.79 
 
 		 97 aa  95.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0515948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.92 
 
 		 96 aa  94.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.811955 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3806  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50.53 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0101066  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6596  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  53.61 
 
 		 96 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2207  H-NS histone family protein  44.21 
 
 		 96 aa  93.6  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000144624  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50 
 
 		 91 aa  93.6  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222409  normal  0.184824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50.53 
 
 		 99 aa  93.6  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4935  putative H-NS histon-like DNA-binding protein  49.51 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.529231  normal  0.833407 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2867  H-NS histone family protein  45.92 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0084  H-NS histone family protein  45.92 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3862  H-NS histone family protein  45.92 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3002  H-NS histone family protein  43.16 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1239  H-NS histone family protein  43.16 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000958752  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3109  H-NS histone family protein  45.92 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0132  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  43.3 
 
 		 99 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0401  H-NS histone family protein  43.16 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000304691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1677  H-NS histone family protein  45.92 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1739  H-NS histone family protein  43.16 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3442  H-NS histone family protein  45.92 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3943  H-NS histone family protein  45.92 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2886  H-NS histone family protein  43.16 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000145694  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1551  H-NS histone family protein  43.16 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000358636  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1174  H-NS histone family protein  48.96 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2442  H-NS histone family protein  48.96 
 
 		 131 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1706  H-NS histone family protein  48.96 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0742  H-NS histone family protein  48.96 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0720  H-NS histone family protein  48.96 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.88 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1247  H-NS histone family protein  48.96 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0231  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50.52 
 
 		 98 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.48 
 
 		 98 aa  90.9  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0265  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50.5 
 
 		 98 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2858  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  50.52 
 
 		 98 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.259744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0249  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50.52 
 
 		 98 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6929  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.02 
 
 		 99 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.599841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.47 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0162  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.48 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121985  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0175  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.48 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.47 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5335  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  44.44 
 
 		 101 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5527  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.44 
 
 		 101 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4746  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.44 
 
 		 101 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587516  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0365  H-NS histone family protein  42.11 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000040716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3351  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  49.48 
 
 		 98 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.383074 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3154  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  51 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5214  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2981  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.48 
 
 		 100 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207499  decreased coverage  0.0000000417224 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0068  H-NS histone family protein  47.96 
 
 		 99 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000181219  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1570  H-NS histone family protein  48.45 
 
 		 173 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000103893  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6382  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49 
 
 		 99 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193522  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1225  H-NS histone family protein  47.96 
 
 		 99 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000571024  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5767  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1136  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  46.15 
 
 		 104 aa  87  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00265311  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0398  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.88 
 
 		 100 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6347  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  47.96 
 
 		 516 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000113528  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6084  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3189  H-NS histone family protein  46.39 
 
 		 98 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0098  H-NS histone family protein  47.96 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000405362  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1506  H-NS histone family protein  47.96 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000220305  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0079  H-NS histone family protein  47.96 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.0000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4321  putative HNS-like transcriptional regulator  43.88 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6382  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  46.94 
 
 		 589 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493779  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0838  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.75 
 
 		 94 aa  83.6  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7383  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  47.42 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2714  DNA-binding protein BprA  44.79 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344106  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.31 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4850  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.83 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5655  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  52.48 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>