More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0316 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  77.3 
 
 		 445 aa  689    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  76.58 
 
 		 444 aa  688    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  81.98 
 
 		 464 aa  731    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  100 
 
 		 444 aa  887    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  52.91 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  51.78 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  50.72 
 
 		 446 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  46.74 
 
 		 447 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  46.29 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  45.17 
 
 		 447 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  45.17 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  45.5 
 
 		 446 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  44.32 
 
 		 445 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4116  hypothetical protein  44.77 
 
 		 445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  40.49 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  40.49 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  40.81 
 
 		 434 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  41.41 
 
 		 442 aa  288  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  39.86 
 
 		 434 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  38.24 
 
 		 443 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  39.12 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  36.08 
 
 		 441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  33.86 
 
 		 440 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  35.93 
 
 		 443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  36.52 
 
 		 460 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  38.27 
 
 		 489 aa  236  7e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  32.06 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  33.73 
 
 		 419 aa  169  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.48 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.61 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  25.54 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  26.81 
 
 		 445 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.61 
 
 		 430 aa  100  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.23 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  29.13 
 
 		 363 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.1 
 
 		 444 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.61 
 
 		 444 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  32.56 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  33.01 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  32 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.95 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.63 
 
 		 465 aa  79.7  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.81 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.81 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  32.47 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  31.48 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.35 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.02 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.81 
 
 		 494 aa  75.1  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.27 
 
 		 669 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  31.08 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  31.62 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  27.23 
 
 		 321 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.96 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.19 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.43 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  27.23 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  27.23 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  30.81 
 
 		 691 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.12 
 
 		 678 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.92 
 
 		 681 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.47 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  25.39 
 
 		 605 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  28.23 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.02 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  30.22 
 
 		 678 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  25.56 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  29 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.33 
 
 		 675 aa  68.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.21 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.17 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  31.08 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.73 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.86 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  29.73 
 
 		 321 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  24.09 
 
 		 465 aa  67  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  22.33 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.22 
 
 		 676 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1752  oxidoreductase  29.79 
 
 		 316 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000180781 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  29.79 
 
 		 321 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.79 
 
 		 368 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4810  ferredoxin  32.68 
 
 		 330 aa  66.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1301  ferric reductase domain protein transmembrane component  25.85 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  24.24 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1517  oxidoreductase  29.08 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  24.24 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  32.61 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.32 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.32 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  32.24 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  29.05 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  30.22 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6193  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.06 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0211684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  28.65 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  30.82 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  29.79 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.27 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.7 
 
 		 585 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  23.74 
 
 		 232 aa  62  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000975827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.22 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>