290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3257 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 297 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  81.69 
 
 		 297 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  81.36 
 
 		 297 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  70.51 
 
 		 296 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  71.96 
 
 		 297 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  82.59 
 
 		 226 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  76.47 
 
 		 241 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  66.11 
 
 		 299 aa  347  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  60.68 
 
 		 295 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  61.74 
 
 		 298 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  59.8 
 
 		 296 aa  332  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  59.06 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  57.43 
 
 		 296 aa  328  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  58.98 
 
 		 295 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  60.4 
 
 		 298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  60.07 
 
 		 298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  58.64 
 
 		 299 aa  319  3.9999999999999996e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  59.46 
 
 		 298 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  58.86 
 
 		 299 aa  317  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  58.8 
 
 		 299 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  62.96 
 
 		 298 aa  316  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  59.46 
 
 		 325 aa  312  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  57.91 
 
 		 296 aa  311  6.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  58.5 
 
 		 292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  54.21 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  56.36 
 
 		 291 aa  295  8e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  55.56 
 
 		 291 aa  291  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  54.58 
 
 		 291 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  58.45 
 
 		 297 aa  285  9e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  54.58 
 
 		 291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  58.3 
 
 		 289 aa  277  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  53.29 
 
 		 291 aa  272  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  60.09 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  52.04 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  53.23 
 
 		 299 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  52.31 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  45.12 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  50.19 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  45.6 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  45.81 
 
 		 432 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  50 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  45.31 
 
 		 429 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  45.78 
 
 		 420 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  41.38 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  44.22 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  49.01 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  47.91 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  47.51 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  44.49 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  43.5 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  46.15 
 
 		 264 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  46.55 
 
 		 410 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  49.52 
 
 		 237 aa  169  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  44.1 
 
 		 435 aa  168  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  44.3 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  44.74 
 
 		 419 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  41.3 
 
 		 275 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  46.12 
 
 		 419 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  45.81 
 
 		 407 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  46.6 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  46.6 
 
 		 326 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  48.02 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  46.6 
 
 		 326 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  43.78 
 
 		 404 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  50.5 
 
 		 237 aa  165  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  46.26 
 
 		 406 aa  165  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  46.22 
 
 		 372 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  48.74 
 
 		 279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  50.25 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  45.58 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  46.22 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  47.74 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  40.46 
 
 		 410 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  47.74 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  47.26 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  40.23 
 
 		 398 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  47.2 
 
 		 404 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  47.57 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  40.79 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  43.32 
 
 		 429 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 		 454 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  47.12 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  42.57 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  42.91 
 
 		 418 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 		 568 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  47.78 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  43.32 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  43.13 
 
 		 400 aa  159  4e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  45.08 
 
 		 404 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  42.91 
 
 		 418 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  46.73 
 
 		 281 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  46.73 
 
 		 281 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  46.73 
 
 		 281 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  46.73 
 
 		 281 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  46.73 
 
 		 281 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  43.13 
 
 		 400 aa  158  8e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  41.15 
 
 		 411 aa  158  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  47.29 
 
 		 316 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  44.17 
 
 		 325 aa  158  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  46.31 
 
 		 281 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>