More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1541 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  383  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  47.59 
 
 		 187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  47.57 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  41.8 
 
 		 189 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  41.8 
 
 		 189 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  41.8 
 
 		 189 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  41.8 
 
 		 189 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  45.4 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  41.27 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  46.54 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  46.54 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  46.54 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  46.54 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  46.54 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  46.54 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  46.54 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  48.32 
 
 		 192 aa  144  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  48.32 
 
 		 192 aa  144  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  44 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  35.79 
 
 		 202 aa  120  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  39.77 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  41.51 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  38.14 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  38.25 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  40.88 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  31.35 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  40.25 
 
 		 214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  39.24 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  38.12 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  39.62 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  34.94 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  41.01 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  41.01 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  36.25 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  38.82 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  39.16 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  35.81 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  34.73 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  34.27 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  30.34 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  34.64 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  35 
 
 		 203 aa  101  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  33.7 
 
 		 206 aa  100  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  38.99 
 
 		 218 aa  99  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  40.33 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  33.54 
 
 		 179 aa  95.5  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  30.82 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  29.59 
 
 		 189 aa  92.8  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  28.04 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  41.73 
 
 		 196 aa  88.2  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  41.73 
 
 		 196 aa  88.2  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  28.19 
 
 		 187 aa  87.8  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  31.89 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  30.36 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  27.22 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  30.73 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  26.37 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  31.46 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  32.02 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  27.66 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2694  inner membrane protein YohD  38.33 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  25.14 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  26.37 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  26.92 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  26.37 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.33 
 
 		 521 aa  75.1  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  26.37 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  25.68 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  25.68 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  32.12 
 
 		 211 aa  74.3  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.56 
 
 		 676 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  31.62 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  33.17 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  25.27 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  28.24 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  25.27 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.49 
 
 		 457 aa  72  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  34.69 
 
 		 686 aa  71.2  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  30.89 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  24.73 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  30.05 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  34.86 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  32.99 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  29.49 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  28.21 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  28.43 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  29.26 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  25.97 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  31.48 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  27.69 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0574  hypothetical protein  32.54 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  27.56 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  29.9 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.79 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  29.94 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>