More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0653 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 357 aa  723    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  68.93 
 
 		 427 aa  482  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1212  hypothetical protein  42.99 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000214097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  40.85 
 
 		 326 aa  253  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4571  secretion protein HlyD family protein  49.84 
 
 		 349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02435  hypothetical protein  41.46 
 
 		 326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  39.33 
 
 		 324 aa  235  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  39.33 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  39.63 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  39.33 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  39.75 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  39.63 
 
 		 324 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  39.63 
 
 		 324 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  38.72 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4393  secretion protein HlyD family protein  40.74 
 
 		 323 aa  229  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  39.33 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  38.72 
 
 		 326 aa  225  7e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0567  secretion protein HlyD family protein  38.89 
 
 		 323 aa  225  8e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.142155 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0477  hypothetical protein  37.92 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1840  hypothetical protein  38.46 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.137202  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0396  secretion protein HlyD family protein  37.87 
 
 		 330 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0604  secretion protein HlyD family protein  42.81 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3745  secretion protein HlyD family protein  39.56 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  38.08 
 
 		 322 aa  216  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0618  putative secretion protein, HlyD family  36.7 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3729  secretion protein HlyD family protein  35.87 
 
 		 329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1173  secretion protein HlyD family protein  41.98 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  37.88 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  37.71 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  37.37 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  37.27 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2703  secretion protein HlyD family protein  35.8 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  36.48 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  29.41 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  30.12 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  28.88 
 
 		 328 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  27.9 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  29.15 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  26.03 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  30.94 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  26.97 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  26.97 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  29.65 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2701  secretion protein HlyD family protein  26.3 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  27.2 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  30.51 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  30.24 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  28.76 
 
 		 347 aa  99.4  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  27.44 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  24.91 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  29.94 
 
 		 342 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  27.84 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  28.44 
 
 		 340 aa  96.7  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  28.78 
 
 		 344 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  27.99 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  25.06 
 
 		 394 aa  93.6  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  23.94 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  26.48 
 
 		 329 aa  91.3  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.12 
 
 		 462 aa  90.5  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  26.69 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  29.94 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  30.88 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  29.94 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  29.94 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  29.94 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  28.15 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  29.94 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.71 
 
 		 467 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  27.6 
 
 		 335 aa  87.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  28.61 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  23.68 
 
 		 349 aa  87  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  27.31 
 
 		 344 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  29.05 
 
 		 331 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  29.05 
 
 		 331 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  29.05 
 
 		 331 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  29.05 
 
 		 331 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  29.05 
 
 		 331 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  29.05 
 
 		 332 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  29.05 
 
 		 332 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  29.05 
 
 		 331 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  26.91 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  27.42 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  25.06 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.86 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  25.23 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.69 
 
 		 496 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  25.23 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  28.75 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  26.23 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  27.42 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  23.86 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  27.93 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.73 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  27.88 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  29.55 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  25.79 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  28.25 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>