227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0531 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  100 
 
 		 236 aa  488  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  48.42 
 
 		 248 aa  214  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  40 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  42.52 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  37.27 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  31.32 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  37.5 
 
 		 272 aa  92  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  37.93 
 
 		 304 aa  91.7  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  40.8 
 
 		 270 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  38.13 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  39.2 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  31.61 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 274 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  29.95 
 
 		 262 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  29.95 
 
 		 262 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  30.05 
 
 		 253 aa  88.2  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  37.6 
 
 		 265 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  29.73 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  38.4 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  39.47 
 
 		 271 aa  87  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  29.44 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  39.47 
 
 		 272 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  40.2 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  37.5 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  37.5 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  38.4 
 
 		 271 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  37.5 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  29.44 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  39.47 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  39.47 
 
 		 279 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  30.34 
 
 		 271 aa  85.9  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  31.72 
 
 		 322 aa  85.5  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  37.86 
 
 		 258 aa  85.5  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  38.6 
 
 		 271 aa  85.5  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  37.4 
 
 		 268 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  30.24 
 
 		 263 aa  85.1  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  29.12 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  37.4 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  30.65 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  28.72 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  29.44 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  30.65 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  30.65 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  26.41 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  30.65 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  28.72 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  28.72 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  28.72 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  28.72 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  28.72 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  30.65 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  30.65 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  30.65 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  30.65 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  37.72 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  33.89 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  33.89 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  29.7 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  36.21 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  29.74 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  28.19 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  29.93 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  35.58 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  28.71 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  28.92 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  27.76 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  27.93 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  38.6 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  29.41 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  29.41 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  29.41 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  29.57 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  37.5 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  31.36 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  31.36 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  27.94 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  37.29 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  36.89 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  31.88 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  30.11 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  28.43 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  29.65 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  34.35 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  34.45 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  31.09 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  32.21 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>